| 1 | Fernandes Filipa Viamonte | 2002 | POR Vitoria Sport Clube/Olicargo | 01'05''16 | 588 |  |  | |
50m 30.75 (30.75) 100m 1:05.16 (34.41) [1:05.16] |
| 2 | Rosa Beatriz Jong | 2000 | POR Clube Desportivo Nacional | 01'05''67 | 575 | | | |
50m 31.40 (31.40) 100m 1:05.67 (34.27) [1:05.67] |
| 3 | Monteiro Ines Rosado | 2000 | POR Clube Natacao De Vagos | 01'05''84 | 570 | | | |
50m 31.24 (31.24) 100m 1:05.84 (34.60) [1:05.84] |
| 4 | Gomes Susana Clara | 1977 | POR Clube Naval Do Funchal | 01'06''15 | 562 | | | |
50m 30.75 (30.75) 100m 1:06.15 (35.40) [1:06.15] |
| 5 | Martins Mariana Sousa | 1995 | POR Clube Desportivo Feirense | 01'07''09 | 539 | | | |
50m 31.73 (31.73) 100m 1:07.09 (35.36) [1:07.09] |
| 6 | Mendes Mariana Sebastiao | 2001 | POR Portinado-Assoc Natacao De Portimao | 01'07''49 | 529 | | | |
50m 31.41 (31.41) 100m 1:07.49 (36.08) [1:07.49] |
| 7 | Rodrigues Joana Francisca | 2004 | POR Clube Uniao 1919 | 01'07''70 | 524 | | | |
50m 31.52 (31.52) 100m 1:07.70 (36.18) [1:07.70] |
| 8 | Guerra Sara Costa | 1999 | POR Clube De Natacao De Lisboa | 01'07''83 | 521 | | | |
50m 31.87 (31.87) 100m 1:07.83 (35.96) [1:07.83] |
| 9 | Silva Carolina Santos | 1986 | POR Ginasio Clube De Santo Tirso | 01'08''46 | 507 | | | |
50m 32.08 (32.08) 100m 1:08.46 (36.38) [1:08.46] |
| 10 | Almeida Ana Beatriz | 2001 | POR Clube Assoc Cult Rec Trab Camara De Vouzela | 01'08''75 | 501 | | | |
50m 31.79 (31.79) 100m 1:08.75 (36.96) [1:08.75] |
| 11 | Rodrigues Daniela Oliveira | 2002 | POR Clube De Natacao De Valongo | 01'08''78 | 500 | | | |
50m 32.25 (32.25) 100m 1:08.78 (36.53) [1:08.78] |
| 12 | Lourenco Alice Carmo | 2002 | POR Viana Natacao Clube | 01'08''86 | 498 | | | |
50m 32.52 (32.52) 100m 1:08.86 (36.34) [1:08.86] |
| | Machado Carolina Alexandra | 2003 | POR Clube Natacao De Beja | 01'08''86 | 498 | | | |
50m 32.60 (32.60) 100m 1:08.86 (36.26) [1:08.86] |
| 14 | Dias Mafalda Sofia | 2001 | POR Palmela Desporto Eem | 01'09''11 | 493 | | | |
50m 32.72 (32.72) 100m 1:09.11 (36.39) [1:09.11] |
| 15 | Santos Beatriz Rocha | 2002 | POR Clube Desportivo De Campinho | 01'09''32 | 488 | | | |
50m 32.20 (32.20) 100m 1:09.32 (37.12) [1:09.32] |
| 16 | Fidalgo Maria Jardim | 2004 | POR Clube Natacao Colegio Vasco Da Gama | 01'09''90 | 476 | | | |
50m 32.88 (32.88) 100m 1:09.90 (37.02) [1:09.90] |
| 17 | Bento Joana Viegas | 1999 | POR Clube De Natacao De Faro | 01'10''22 | 470 | | | |
50m 32.83 (32.83) 100m 1:10.22 (37.39) [1:10.22] |
| 18 | Silva Margarida Borges | 2004 | POR Clube Act Fisica Bomb. De Ponta Delgada | 01'10''26 | 469 | | | |
50m 32.36 (32.36) 100m 1:10.26 (37.90) [1:10.26] |
| 19 | Barros Alexia Bastos | 2004 | POR Associacao Desportiva De Fafe | 01'10''41 | 466 | | | |
50m 33.38 (33.38) 100m 1:10.41 (37.03) [1:10.41] |
| 20 | Dias Ana Leonor | 2002 | POR Clube Natacao De Olhao | 01'10''55 | 463 | | | |
50m 33.06 (33.06) 100m 1:10.55 (37.49) [1:10.55] |
| 21 | Vera Vinhais Ribeiro De Figueitedo Narra Vera Figueiredo | 2004 | POR Clube Natacao Da Amadora | 01'10''68 | 461 | | | |
50m 32.06 (32.06) 100m 1:10.68 (38.62) [1:10.68] |
| 22 | Fougo Rita Claudia | 1988 | POR Clube De Natacao Da Maia | 01'11''20 | 451 | | | |
50m 32.44 (32.44) 100m 1:11.20 (38.76) [1:11.20] |
| 23 | Mendes Lea Alexandra | 2003 | POR Sociedade Filarmonica Gualdim Pais | 01'11''35 | 448 | | | |
50m 32.61 (32.61) 100m 1:11.35 (38.74) [1:11.35] |
| 24 | Lima Catarina Cardoso | 2004 | POR Clube Naval Povoense | 01'11''58 | 444 | | | |
50m 33.53 (33.53) 100m 1:11.58 (38.05) [1:11.58] |
| 25 | Resendes Ana Marta | 1980 | POR Clube Naval De Ponta Delgada | 01'11''95 | 437 | | | |
50m 33.62 (33.62) 100m 1:11.95 (38.33) [1:11.95] |
| 26 | Paiva Leonor Correia | 2004 | POR Associacao Louzan Natacao | 01'12''06 | 435 | | | |
50m 33.76 (33.76) 100m 1:12.06 (38.30) [1:12.06] |
| 27 | Caxaria Marta Sousa | 2003 | POR Clube Natacao Do Montijo | 01'12''12 | 434 | | | |
50m 33.35 (33.35) 100m 1:12.12 (38.77) [1:12.12] |
| 28 | Macedo Luisa Mendes | 2003 | POR Associacao Desportiva Sanjoanense/Fepsa | 01'13''50 | 410 | | | |
50m 34.00 (34.00) 100m 1:13.50 (39.50) [1:13.50] |
| 29 | Moura Beatriz Catarino | 2002 | POR Clube Nautico De Abrantes | 01'17''74 | 346 | | | |
50m 35.35 (35.35) 100m 1:17.74 (42.39) [1:17.74] |
| 30 | Alves Ana Barbara | 2001 | POR Associacao Ed. Fisica Desp. Torres Vedras | 01'19''24 | 327 | | | |
50m 36.12 (36.12) 100m 1:19.24 (43.12) [1:19.24] |
| 31 | Ferreira Ana Andrade | 2003 | POR Associacao Estamos Juntos | 01'20''86 | 308 | | | |
50m 37.02 (37.02) 100m 1:20.86 (43.84) [1:20.86] |
| 32 | Pinto Susana Ferreira | 2001 | POR Assoc Pais Amigos Criancas Gafanha Da Encarnacao | 01'27''58 | 242 | | | |
50m 41.18 (41.18) 100m 1:27.58 (46.40) [1:27.58] |
