| 1 | De Pinho Rodrigues Ana | 1994 | POR Associacao Desportiva Sanjoanense/Fepsa | 00'56''63 | 698 |  |  | |
50m 27.45 (27.45) 100m 56.63 (29.18) [56.63] |
| 2 | Fernandes Ana Ines | 2000 | POR Vitoria Sport Clube/Olicargo | 00'59''88 | 590 | | | |
50m 29.05 (29.05) 100m 59.88 (30.83) [59.88] |
| 3 | Soares Carolina Silva | 2003 | POR Clube De Natacao De Valongo | 01'00''16 | 582 | | | |
50m 29.36 (29.36) 100m 1:00.16 (30.80) [1:00.16] |
| 4 | Marques Maria Vieira | 2004 | POR Clube Natacao De Vagos | 01'00''55 | 571 | | | |
50m 29.00 (29.00) 100m 1:00.55 (31.55) [1:00.55] |
| 5 | Santos Carolina Ascenso | 2001 | POR Ginasio Clube De Santo Tirso | 01'01''30 | 550 | | | |
50m 29.73 (29.73) 100m 1:01.30 (31.57) [1:01.30] |
| 6 | Aguilar Vera Ines | 2000 | POR Clube Desportivo Nacional | 01'01''50 | 545 | | | |
50m 29.44 (29.44) 100m 1:01.50 (32.06) [1:01.50] |
| 7 | Lopes Carolina Sofia | 1996 | POR Clube De Natacao De Faro | 01'01''57 | 543 | | | |
50m 29.03 (29.03) 100m 1:01.57 (32.54) [1:01.57] |
| | Ferreira Leonie Cunha | 2000 | POR Clube Naval Povoense | 01'01''57 | 543 | | | |
50m 29.55 (29.55) 100m 1:01.57 (32.02) [1:01.57] |
| 9 | Correia Rute Ferreira | 2003 | POR Clube Assoc Cult Rec Trab Camara De Vouzela | 01'01''62 | 542 | | | |
50m 29.46 (29.46) 100m 1:01.62 (32.16) [1:01.62] |
| 10 | Costa Mafalda Magalhaes | 2003 | POR Sociedade Filarmonica Gualdim Pais | 01'01''77 | 538 | | | |
50m 29.27 (29.27) 100m 1:01.77 (32.50) [1:01.77] |
| 11 | Gomes Susana Clara | 1977 | POR Clube Naval Do Funchal | 01'01''81 | 537 | | | |
50m 29.41 (29.41) 100m 1:01.81 (32.40) [1:01.81] |
| 12 | Dias Ana Leonor | 2002 | POR Clube Natacao De Olhao | 01'01''86 | 536 | | | |
50m 29.96 (29.96) 100m 1:01.86 (31.90) [1:01.86] |
| 13 | Ligeiro Daniela Silva | 2004 | POR Viana Natacao Clube | 01'02''83 | 511 | | | |
50m 30.07 (30.07) 100m 1:02.83 (32.76) [1:02.83] |
| 14 | Brites Marta Lopes | 2006 | POR Clube Naval De Ponta Delgada | 01'02''90 | 509 | | | |
50m 29.71 (29.71) 100m 1:02.90 (33.19) [1:02.90] |
| 15 | Jones Angelina Bermejo | 2004 | POR Portinado-Assoc Natacao De Portimao | 01'03''08 | 505 | | | |
50m 30.63 (30.63) 100m 1:03.08 (32.45) [1:03.08] |
| 16 | Pires Beatriz Almeida | 2003 | POR Clube Uniao 1919 | 01'03''19 | 502 | | | |
50m 30.14 (30.14) 100m 1:03.19 (33.05) [1:03.19] |
| 17 | Salgado Soraia Maria | 2005 | POR Associacao Ed. Fisica Desp. Torres Vedras | 01'03''75 | 489 | | | |
50m 30.39 (30.39) 100m 1:03.75 (33.36) [1:03.75] |
| 18 | Caetana Vidal Goncalves Neves Carneiro Caetana Neves | 2003 | POR Clube De Natacao De Lisboa | 01'03''97 | 484 | | | |
50m 30.27 (30.27) 100m 1:03.97 (33.70) [1:03.97] |
| 19 | Silva Margarida Mota | 2003 | POR Palmela Desporto Eem | 01'04''02 | 483 | | | |
50m 30.59 (30.59) 100m 1:04.02 (33.43) [1:04.02] |
| 20 | Carvalho Leonor Rodrigues | 2002 | POR Clube Act Fisica Bomb. De Ponta Delgada | 01'04''11 | 481 | | | |
50m 30.71 (30.71) 100m 1:04.11 (33.40) [1:04.11] |
| 21 | Coelho Ines Pinho | 1999 | POR Clube Desportivo Feirense | 01'04''49 | 473 | | | |
50m 31.56 (31.56) 100m 1:04.49 (32.93) [1:04.49] |
| 22 | Oliveira Ana Beatriz | 2004 | POR Associacao Desportiva De Fafe | 01'04''70 | 468 | | | |
50m 30.79 (30.79) 100m 1:04.70 (33.91) [1:04.70] |
| 23 | Moura Beatriz Catarino | 2002 | POR Clube Nautico De Abrantes | 01'05''14 | 459 | | | |
50m 31.06 (31.06) 100m 1:05.14 (34.08) [1:05.14] |
| 24 | Santos Beatriz Rocha | 2002 | POR Clube Desportivo De Campinho | 01'05''40 | 453 | | | |
50m 31.50 (31.50) 100m 1:05.40 (33.90) [1:05.40] |
| 25 | Marques Marta Viola | 2003 | POR Clube Natacao Colegio Vasco Da Gama | 01'05''51 | 451 | | | |
50m 31.59 (31.59) 100m 1:05.51 (33.92) [1:05.51] |
| 26 | Teixeira Ines Correia | 2006 | POR Clube Natacao Da Amadora | 01'05''65 | 448 | | | |
50m 31.70 (31.70) 100m 1:05.65 (33.95) [1:05.65] |
| 27 | Esteves Ana Jorge | 2001 | POR Assoc Pais Amigos Criancas Gafanha Da Encarnacao | 01'05''70 | 447 | | | |
50m 31.12 (31.12) 100m 1:05.70 (34.58) [1:05.70] |
| 28 | Rodrigues Ana Luisa | 2003 | POR Associacao Louzan Natacao | 01'06''26 | 436 | | | |
50m 31.81 (31.81) 100m 1:06.26 (34.45) [1:06.26] |
| 29 | Oliveira Maria Miguel | 1997 | POR Clube De Natacao Da Maia | 01'09''30 | 381 | | | |
50m 32.06 (32.06) 100m 1:09.30 (37.24) [1:09.30] |
| 30 | Castro Sara Alexandra | 2004 | POR Clube Natacao Do Montijo | 01'09''64 | 375 | | | |
50m 32.89 (32.89) 100m 1:09.64 (36.75) [1:09.64] |
| | Costa Erica Regina | 2002 | POR Associacao Estamos Juntos | 01'09''64 | 375 | | | |
50m 33.50 (33.50) 100m 1:09.64 (36.14) [1:09.64] |
| 32 | Lampreia Patricia Isabel | 2004 | POR Clube Natacao De Beja | 01'13''32 | 321 | | | |
50m 34.95 (34.95) 100m 1:13.32 (38.37) [1:13.32] |
