| 1 | Castro Maria Freitas | 2003 | POR Associacao Desportiva De Fafe | 01'15''10 | 572 |  |  | |
50m 35.73 (35.73) 100m 1:15.10 (39.37) [1:15.10] |
| 2 | Maia Joana Marques | 1991 | POR Ginasio Clube De Santo Tirso | 01'15''70 | 559 | | | |
50m 36.26 (36.26) 100m 1:15.70 (39.44) [1:15.70] |
| 3 | Goncalves Sofia Filipa | 2001 | POR Leixoes Sport Club | 01'16''98 | 531 | | | |
50m 37.37 (37.37) 100m 1:16.98 (39.61) [1:16.98] |
| 4 | Oliveira Mafalda Joana | 2002 | POR Clube Aquatico Pacense | 01'17''13 | 528 | | | |
50m 37.09 (37.09) 100m 1:17.13 (40.04) [1:17.13] |
| 5 | Rodrigues Marta Silva | 2004 | POR Clube Naval Povoense | 01'18''46 | 502 | | | |
50m 37.73 (37.73) 100m 1:18.46 (40.73) [1:18.46] |
| 6 | Machado Joana Sofia | 2002 | POR Clube De Natacao De Valongo | 01'18''71 | 497 | | | |
50m 36.86 (36.86) 100m 1:18.71 (41.85) [1:18.71] |
| 7 | Lopes Francisca Macedo | 2005 | POR Clube Fluvial Vilacondense | 01'19''03 | 491 | | | |
50m 37.24 (37.24) 100m 1:19.03 (41.79) [1:19.03] |
| 8 | Vieira Valeria Goncalves | 2002 | POR Vitoria Sport Clube/Olicargo | 01'20''15 | 470 | | | |
50m 37.67 (37.67) 100m 1:20.15 (42.48) [1:20.15] |
| 9 | Martins Margarida Carvalhal | 2005 | POR Grupo Desportivo De Natacao De Vila Nova De Famalicao | 01'22''68 | 429 | | | |
50m 38.72 (38.72) 100m 1:22.68 (43.96) [1:22.68] |
| 10 | Leite Sofia Margarida | 2003 | POR Foca-Clube Natacao De Felgueiras | 01'27''56 | 361 | | | |
50m 40.92 (40.92) 100m 1:27.56 (46.64) [1:27.56] |
| 11 | Rangel Beatriz Pereira | 2004 | POR Clube Fluvial Portuense | 01'28''06 | 355 | | | |
50m 41.90 (41.90) 100m 1:28.06 (46.16) [1:28.06] |
| 12 | Magalhaes Ana Catarina | 2002 | POR Associacao Desportiva De Penafiel | 01'29''78 | 335 | | | |
50m 41.31 (41.31) 100m 1:29.78 (48.47) [1:29.78] |
| 13 | Yuxuan Bella Li | 2006 | POR Colegio Luso-Internacional Do Porto | 01'37''22 | 263 | | | |
50m 46.26 (46.26) 100m 1:37.22 (50.96) [1:37.22] |
| 14 | Dias Fabia Barbosa | 2005 | POR Clube De Natacao Da Maia | 01'38''17 | 256 | | | |
50m 45.80 (45.80) 100m 1:38.17 (52.37) [1:38.17] |
