| 1 | Oliveira Ana Rita | 2004 | POR Clube Naval Povoense | 01'05''67 | 588 |  |  | |
50m 32.08 (32.08) 100m 1:05.67 (33.59) [1:05.67] |
| 2 | Costa Beatriz Neto | 2000 | POR Clube Aquatico Pacense | 01'09''72 | 491 | | | |
50m 33.99 (33.99) 100m 1:09.72 (35.73) [1:09.72] |
| 3 | Macedo Rosana Marinho | 1999 | POR Foca-Clube Natacao De Felgueiras | 01'10''36 | 478 | | | |
50m 33.71 (33.71) 100m 1:10.36 (36.65) [1:10.36] |
| 4 | Neves Natalia Passeira | 2005 | POR Clube De Natacao De Valongo | 01'11''16 | 462 | | | |
50m 34.32 (34.32) 100m 1:11.16 (36.84) [1:11.16] |
| 5 | Goncalves Sofia Filipa | 2001 | POR Leixoes Sport Club | 01'11''61 | 453 | | | |
50m 34.77 (34.77) 100m 1:11.61 (36.84) [1:11.61] |
| 6 | Rocha Carolina Neves | 2004 | POR Clube Fluvial Portuense | 01'11''95 | 447 | | | |
50m 34.69 (34.69) 100m 1:11.95 (37.26) [1:11.95] |
| 7 | Costa Mariana Martins | 2005 | POR Grupo Desportivo De Natacao De Vila Nova De Famalicao | 01'12''31 | 440 | | | |
50m 34.81 (34.81) 100m 1:12.31 (37.50) [1:12.31] |
| 8 | Batista Barbara Vivas | 2004 | POR Colegio Luso-Internacional Do Porto | 01'14''55 | 402 | | | |
50m 37.12 (37.12) 100m 1:14.55 (37.43) [1:14.55] |
| 9 | Gomes Mariana Filipa | 2004 | POR Associacao Desportiva De Penafiel | 01'15''38 | 389 | | | |
50m 36.89 (36.89) 100m 1:15.38 (38.49) [1:15.38] |
| 10 | Oliveira Maria Miguel | 1997 | POR Clube De Natacao Da Maia | 01'18''05 | 350 | | | |
50m 37.28 (37.28) 100m 1:18.05 (40.77) [1:18.05] |
| | Troia Barbara Daniela | 2004 | POR Clube Fluvial Vilacondense | Squalificato | |
