| 1 | Ramos Andre Miguel | 2007 | POR Associacao Ed. Fisica Desp. Torres Vedras | 00'57''62 | 632 |  |  | |
50m 27.11 (27.11) 100m 57.62 (30.51) [57.62] |
| 2 | Januario Tomas Maia | 2006 | POR Sport Lisboa E Benfica | 00'59''03 | 587 | | | |
50m 27.37 (27.37) 100m 59.03 (31.66) [59.03] |
| 3 | Pinto Andre Mota Deniz | 2006 | POR Sporting Clube De Portugal | 00'59''84 | 564 | | | |
50m 27.64 (27.64) 100m 59.84 (32.20) [59.84] |
| 4 | Morais David Miguel | 2006 | POR Sport Lisboa E Benfica | 01'00''05 | 558 | | | |
50m 28.22 (28.22) 100m 1:00.05 (31.83) [1:00.05] |
| 5 | Figueira Diogo Morgado | 2006 | POR Centro Popular De Cultura E Desporto Povoa De Santa Iria | 01'00''31 | 551 | | | |
50m 27.97 (27.97) 100m 1:00.31 (32.34) [1:00.31] |
| 6 | Figueiredo Luis Pedro | 2006 | POR Gesloures-Gestao Equip. Sociais, Em | 01'00''66 | 541 | | | |
50m 28.27 (28.27) 100m 1:00.66 (32.39) [1:00.66] |
| 7 | Barberi Michele Francesco Neri | 2007 | POR Sporting Clube De Portugal | 01'00''79 | 538 | | | |
50m 28.38 (28.38) 100m 1:00.79 (32.41) [1:00.79] |
| 8 | Godinho Rafael Pacheco | 2007 | POR Sporting Clube De Portugal | 01'01''43 | 521 | | | |
50m 28.82 (28.82) 100m 1:01.43 (32.61) [1:01.43] |
| 9 | Gomes Joao Almeida | 2006 | POR Clube Nacional De Natacao | 01'01''83 | 511 | | | |
50m 29.19 (29.19) 100m 1:01.83 (32.64) [1:01.83] |
| 10 | Bonniz Pedro Goncalves | 2006 | POR Sport Lisboa E Benfica | 01'02''12 | 504 | | | |
50m 28.79 (28.79) 100m 1:02.12 (33.33) [1:02.12] |
| 11 | Carvalho Daniel Casaca | 2007 | POR Clube Natacao Colegio Vasco Da Gama | 01'05''20 | 436 | | | |
50m 29.80 (29.80) 100m 1:05.20 (35.40) [1:05.20] |
| 12 | Simoes Manuel Costa | 2006 | POR Sociedade Filarmonica Uniao Artistica Piedense | 01'05''24 | 435 | | | |
50m 30.27 (30.27) 100m 1:05.24 (34.97) [1:05.24] |
| 13 | Spac Rafael Sergio | 2007 | POR Palmela Desporto Eem | 01'09''72 | 356 | | | |
50m 29.34 (29.34) 100m 1:09.72 (40.38) [1:09.72] |
