| 1 | Schilling Leonardo Andre | 1993 | POR Sport Lisboa E Benfica | 00'23''21 | 731 |
| 2 | Nascimento Miguel Duarte | 1995 | POR Sport Lisboa E Benfica | 00'23''80 | 678 |
| 3 | Souza Da Silva Fernando | 1986 | POR Sociedade Filarmonica Uniao Artistica Piedense | 00'23''82 | 676 |
| 4 | Machado Joao Daniel | 1999 | POR Sociedade Filarmonica Uniao Artistica Piedense | 00'24''08 | 654 |
| 5 | Dias Guilherme Pereira | 1997 | POR Sport Lisboa E Benfica | 00'24''09 | 653 |
| 6 | Madureira Gustavo Almeida | 1994 | POR Seleccao Da Assoc Natacao De Coimbra | 00'24''18 | 646 |
| 7 | Pedro Daniel Rochinha | 1998 | POR Associacao Bombeiros Voluntarios Estoris | 00'24''20 | 645 |
| 8 | Marques Miguel Henriques | 2000 | POR Sport Lisboa E Benfica | 00'24''24 | 641 |
| 9 | Santos Joao Duarte | 1995 | POR Clube Natacao De Olhao | 00'24''25 | 641 |
| 10 | Machado Francisco Carvalho | 1998 | POR Sport Alges E Dafundo | 00'24''35 | 633 |
| 11 | Trygvason Rokur | 2000 | FAR Aegir Klaksvik | 00'24''57 | 616 |
| 12 | Da Cunha Costa Tiago | 1999 | POR Sporting Clube De Portugal | 00'24''62 | 612 |
| 13 | Mogne Igor Araujo | 1996 | POR Sporting Clube De Portugal | 00'24''71 | 605 |
| 14 | Lopes David Granja | 1990 | POR Assoc Orientadora Natacao Desportiva Em Azeitao | 00'24''80 | 599 |
| | Vakulyuk Paulo | 2003 | POR Portugal | 00'24''80 | 599 |
| 16 | Rodrigues Tiago Moura | 2003 | POR Portugal | 00'24''81 | 598 |
| 17 | Ramos Lebre Diogo | 2001 | POR Sport Lisboa E Benfica | 00'25''01 | 584 |
| 18 | Carvalho Ruben Paiva | 1994 | POR Seleccao Da Assoc Natacao De Coimbra | 00'25''07 | 580 |
| 19 | Weustink Koen | 2000 | POR Ginasio Clube De Vila Real | 00'25''08 | 579 |
| 20 | Agostinho Miguel Diogo | 2000 | POR Fundacao Beatriz Santos-Clube | 00'25''15 | 574 |
| 21 | Gomes Rodrigo Ribeiro | 2000 | POR Seleccao Da Assoc Natacao De Coimbra | 00'25''16 | 574 |
| 22 | Pires Ricardo Saraiva | 1998 | POR Clube De Instrucao E Recreio Do Laranjeiro | 00'25''21 | 570 |
| 23 | Balaguer Umsari Daniel | 1994 | POR Louletano Desportos Clube | 00'25''28 | 565 |
| 24 | Dantas Diogo Leal | 2000 | POR Sporting Clube De Portugal | 00'25''29 | 565 |
| 25 | Silva Miguel Vicente | 2002 | POR Desportivo Nautico Da Marinha Grande | 00'25''31 | 563 |
| 26 | Esmeralda Rivas Daniel | 1994 | POR Louletano Desportos Clube | 00'25''33 | 562 |
| 27 | Simoes Bernardo Jorge | 2002 | POR Clube De Natacao De Torres Novas | 00'25''40 | 557 |
| 28 | Gourley Lorcan | 2001 | IRL Larne Swimming Club | 00'25''49 | 552 |
| | Ferrao Goncalo Carvalho | 2001 | POR Clube Desportivo Cova Da Piedade | 00'25''49 | 552 |
| 30 | Gomes Miguel Camara | 1999 | POR Seleccao Da Madeira | 00'25''50 | 551 |
| | Simoes Bernardo Jorge | 2004 | POR Clube Natacao Colegio Vasco Da Gama | 00'25''50 | 551 |
| 32 | Soares Frederico Sousa | 1996 | POR Associacao Bombeiros Voluntarios Estoris | 00'25''61 | 544 |
| 33 | Pinho Manuel Antonio | 2001 | POR Clube Desportivo Feirense | 00'25''66 | 541 |
| 34 | Estevens Ricardo Nuno | 1999 | POR Clube De Instrucao E Recreio Do Laranjeiro | 00'25''77 | 534 |
| 35 | Augusto Bernardo Antunes | 2000 | POR Assoc Orientadora Natacao Desportiva Em Azeitao | 00'25''79 | 532 |
| | Nova Tiago Vila | 2000 | POR Portinado-Assoc Natacao De Portimao | 00'25''79 | 532 |
| 37 | Ferreira Ricardo Pinela | 2001 | POR Sport Lisboa E Benfica | 00'25''80 | 532 |
| 38 | Pereira Ricardo Marques | 2001 | POR Condeixa Aqua Clube | 00'25''84 | 529 |
| 39 | Raposo Joao Tiago Pereira | 2001 | POR Clube Natacao De Sao Bras De Alportel | 00'25''92 | 524 |
| | Miguel Tomas Pedrosa | 2002 | POR Condeixa Aqua Clube | 00'25''92 | 524 |
| 41 | Pereira Joao Neto | 2002 | POR Fundacao Beatriz Santos-Clube | 00'25''93 | 524 |
| 42 | Costa Afonso Filipe | 2003 | POR Clube Naval Da Nazare | 00'25''98 | 521 |
| 43 | Coxixo Tomas Da Silva | 1999 | POR Palmela Desporto Eem | 00'26''00 | 520 |
| 44 | Leal Ricardo Luis | 2001 | POR Clube Lazer Aventura E Competicao | 00'26''01 | 519 |
| | Catarino Joao Mendes | 2001 | POR Clube Futebol De Estremoz | 00'26''01 | 519 |
| 46 | Pelaio Jose Pedro | 2001 | POR Clube Galitos De Aveiro | 00'26''06 | 516 |
| 47 | Brito Bernardo Geada | 2002 | POR Sociedade Filarmonica Uniao Artistica Piedense | 00'26''10 | 514 |
| 48 | Gomes Vicente Oliveira | 2002 | POR Sporting Clube De Portugal | 00'26''14 | 511 |
| 49 | Pimentel Alfredo Eugenio | 2000 | POR Clube De Natacao Do Litoral Alentejano | 00'26''15 | 511 |
| 50 | Jacinto Rafael Rodrigues | 2002 | POR Clube De Futebol Os Belenenses | 00'26''18 | 509 |
| 51 | Pinto Carlos Miguel | 1997 | POR Clube De Natacao De Lisboa | 00'26''20 | 508 |
| | Pires Joao Nuno | 1994 | POR Clube De Natacao Da Guarda | 00'26''20 | 508 |
| 53 | Kondratenko Antonio | 2001 | POR Portinado-Assoc Natacao De Portimao | 00'26''26 | 504 |
| | Saramago Artur Rafael | 1997 | POR Buzios - Associacao De Nadadores Salvadores De Coruche | 00'26''26 | 504 |
| 55 | Mateus Diogo Garcez | 2002 | POR Assoc Orientadora Natacao Desportiva Em Azeitao | 00'26''29 | 503 |
| 56 | Zinca Andrei Iulian | 2000 | POR Assoc Pais Amigos Criancas Gafanha Da Encarnacao | 00'26''30 | 502 |
| 57 | Gomes Diogo Sousa | 2002 | POR Portinado-Assoc Natacao De Portimao | 00'26''32 | 501 |
| | Teixeira Rodrigo Costa | 1999 | POR Clube De Instrucao E Recreio Do Laranjeiro | 00'26''32 | 501 |
| 59 | Mendes Joao Nogueira | 2002 | POR Clube De Instrucao E Recreio Do Laranjeiro | 00'26''37 | 498 |
| 60 | Silva Andre Lopes | 1999 | POR Desportivo Nautico Da Marinha Grande | 00'26''40 | 496 |
| 61 | Fernandes Leandro Rosa | 1999 | POR Centro Popular De Cultura E Desporto Povoa De Santa Iria | 00'26''42 | 495 |
| 62 | Simoes Manuel Baptista | 2003 | POR Clube Uniao 1919 | 00'26''45 | 494 |
| 63 | Matos Guilherme Maria | 2000 | POR Avancado Eulx Ccdesp | 00'26''50 | 491 |
| 64 | Santos Goncalo Duarte | 2000 | POR Clube De Natacao De Faro | 00'26''51 | 490 |
| 65 | Vicente Morgado Ventoso Vicente Morgado | 2000 | POR Avancado Eulx Ccdesp | 00'26''53 | 489 |
| 66 | Luz Filipe Ferreira | 1998 | POR Gesloures-Gestao Equip. Sociais, Em | 00'26''59 | 486 |
| 67 | Carreiro Pedro Dordio | 1997 | POR Gesloures-Gestao Equip. Sociais, Em | 00'26''61 | 485 |
| 68 | Viana Luis Filipe | 1989 | POR Clube Lazer Aventura E Competicao | 00'26''65 | 483 |
| 69 | Marcos Alexandre Teixeira | 2000 | POR Louletano Desportos Clube | 00'26''67 | 481 |
| 70 | Rodrigues Joao Andre | 1999 | POR Gesloures-Gestao Equip. Sociais, Em | 00'26''71 | 479 |
| 71 | Machado Joao Francisco | 1999 | POR Clube Uniao 1919 | 00'26''74 | 478 |
| 72 | Melo Filipe Ferrao | 2001 | POR Clube Naval Setubalense | 00'26''80 | 474 |
| 73 | Barrulas Joao Miguel | 1999 | POR Clube Futebol De Estremoz | 00'26''99 | 465 |
| 74 | Rosa Joao Pedro | 1990 | POR Clube Lazer Aventura E Competicao | 00'27''00 | 464 |
| 75 | Correia Rui Miguel | 1996 | POR Clube Natacao Do Montijo | 00'27''01 | 463 |
| 76 | Dinis Miguel Monteiro | 2001 | POR Sport Alges E Dafundo | 00'27''03 | 462 |
| 77 | Sequeira Pedro Meneses | 2001 | POR Clube Naval Do Funchal | 00'27''04 | 462 |
| 78 | Magalhaes Filipe Nunes | 1998 | POR Clube De Natacao De Lisboa | 00'27''07 | 460 |
| 79 | Boto Pedro Alexandre | 2002 | POR Clube De Natacao Do Litoral Alentejano | 00'27''08 | 460 |
| 80 | Pereira Henrique Saraiva | 2003 | POR Portinado-Assoc Natacao De Portimao | 00'27''14 | 457 |
| 81 | Dias Goncalo Catarino | 2000 | POR Clube Natacao De Rio Maior | 00'27''15 | 456 |
| 82 | Marques Carlos Manuel | 2000 | POR Assoc Natacao Albicastrense Os Redentoristas | 00'27''25 | 451 |
| 83 | Caetano Gino Santos | 1994 | POR Clube Galitos De Aveiro | 00'27''60 | 434 |
| 84 | Angelino Joao Silva | 2004 | POR Palmela Desporto Eem | 00'27''61 | 434 |
| 85 | Carregado Pedro Marques | 2002 | POR Buzios - Associacao De Nadadores Salvadores De Coruche | 00'28''04 | 414 |
| | Cruz Miguel Duarte | 1999 | POR Clube De Futebol Os Belenenses | Squalificato | |
