| 1 | Da Costa Joao Nogueira | 2001 | POR Vitoria Sport Clube/Olicargo | 00'58''28 | 704 |
| 2 | Tinoco Joao Pereira | 2000 | POR Grupo Desportivo De Natacao De Vila Nova De Famalicao | 01'00''55 | 627 |
| 3 | Sampaio Jose Pedro | 1998 | POR Clube Fluvial Portuense | 01'01''45 | 600 |
| 4 | Rocha Ricardo Filipe | 2002 | POR Clube Aquatico Pacense | 01'01''84 | 589 |
| 5 | Zenza Francisco Manuel | 2001 | POR Clube De Natacao Da Maia | 01'02''05 | 583 |
| 6 | Santos Pedro Miguel | 2001 | POR Futebol Clube Do Porto | 01'02''66 | 566 |
| 7 | Goncalves Rodrigo Oliveira | 2002 | POR Futebol Clube Do Porto | 01'03''88 | 534 |
| 8 | Soares Luis Filipe | 1998 | POR Colegio Liceal De Santa Maria De Lamas | 01'04''11 | 529 |
| 9 | Oliveira Rui Goncalves | 1993 | POR Clube De Natacao Da Maia | 01'04''83 | 511 |
| | Marques Andre Costa | 2003 | POR Grupo Desportivo De Natacao De Vila Nova De Famalicao | 01'04''83 | 511 |
| 11 | Freitas Joao Pinto | 2001 | POR Associacao Desportiva De Fafe | 01'05''27 | 501 |
| 12 | Ferreira Bernardo Felgueiras | 2003 | POR Colegio Luso-Internacional Do Porto | 01'05''28 | 501 |
| 13 | Silva Rodrigo Reis | 1998 | POR Colegio Liceal De Santa Maria De Lamas | 01'05''30 | 500 |
| 14 | Ramos Filipe Carmo | 1997 | POR Clube Fluvial Vilacondense | 01'05''45 | 497 |
| 15 | Morim Francisco Emanuel | 2002 | POR Clube Fluvial Vilacondense | 01'05''81 | 489 |
| 16 | Moreira Jose Salgado | 2001 | POR Grupo Desportivo De Natacao De Vila Nova De Famalicao | 01'06''05 | 483 |
| 17 | Martins Samuel Dias | 2002 | POR Colegio Liceal De Santa Maria De Lamas | 01'06''08 | 483 |
| 18 | Araujo Joao Guilherme | 2003 | POR Clube De Natacao Da Maia | 01'06''70 | 469 |
| 19 | Oliveira Joao Andre | 2002 | POR Futebol Clube Do Porto | 01'06''76 | 468 |
| | Araujo Jose Miguel | 2003 | POR Grupo Desportivo De Natacao De Vila Nova De Famalicao | 01'06''76 | 468 |
| 21 | Ferreira Nuno Filipe | 2000 | POR Foca-Clube Natacao De Felgueiras | 01'06''82 | 467 |
| 22 | Kobayashi Bruno Shinji | 2002 | POR Clube Fluvial Vilacondense | 01'06''83 | 467 |
| 23 | Peixoto Joao Freitas | 2001 | POR Associacao Desportiva De Fafe | 01'06''98 | 463 |
| 24 | Ribeiro Joao Pedro | 2002 | POR Clube Fluvial Vilacondense | 01'07''27 | 457 |
| 25 | Santos Andre Miguel | 2000 | POR Clube Fluvial Vilacondense | 01'07''49 | 453 |
| 26 | Folha Diogo Antonio | 2003 | POR Leixoes Sport Club | 01'08''02 | 442 |
| 27 | Barroso Bruno Carvalho | 2001 | POR Leixoes Sport Club | 01'08''76 | 428 |
| 28 | Carvalho Tiago Fonseca | 2003 | POR Clube Naval Povoense | 01'09''15 | 421 |
| 29 | Machado Alexandre Abreu | 2002 | POR Vitoria Sport Clube/Olicargo | 01'09''84 | 409 |
| 30 | Leite Nuno Filipe | 2000 | POR Foca-Clube Natacao De Felgueiras | 01'10''16 | 403 |
| 31 | Mendes Ricardo Ferreira | 2003 | POR Colegio Liceal De Santa Maria De Lamas | 01'10''22 | 402 |
| 32 | Santos Rui Almeida | 2002 | POR Colegio Liceal De Santa Maria De Lamas | 01'10''39 | 399 |
| 33 | Gomes Joao Campelo | 2003 | POR Grupo Desportivo De Natacao De Vila Nova De Famalicao | 01'10''51 | 397 |
| 34 | Faria Pedro Miguel | 2002 | POR Vitoria Sport Clube/Olicargo | 01'10''63 | 395 |
| 35 | Faia Mateus Costa | 2003 | POR Grupo Desportivo De Natacao De Vila Nova De Famalicao | 01'10''78 | 393 |
| 36 | Quinta Jorge Coelho | 2001 | POR Leixoes Sport Club | 01'11''00 | 389 |
| 37 | Pereira Daniel Santos | 2003 | POR Clube De Natacao De Valongo | 01'11''75 | 377 |
| 38 | Terroso Rafael Mesquita | 2002 | POR Clube Fluvial Vilacondense | 01'13''28 | 354 |
| 39 | Almeida Nuno Rocha | 2002 | POR Colegio Liceal De Santa Maria De Lamas | 01'13''48 | 351 |
| 40 | Gomes Tiago Filipe | 2002 | POR Assoc. Propriet. Da Urbanizacao Vila De Este | 01'13''60 | 349 |
| 41 | Picao Jose Pedro | 2001 | POR Leixoes Sport Club | 01'14''39 | 338 |
| 42 | Teixeira Ricardo Jorge | 2000 | POR Clube De Natacao Da Maia | 01'14''86 | 332 |
| 43 | Moura Diogo Goncalves | 2002 | POR Associacao Desportiva De Fafe | 01'15''42 | 324 |
| 44 | Martins Goncalo Traila | 2002 | POR Grupo Desportivo De Natacao De Vila Nova De Famalicao | 01'17''34 | 301 |
| 45 | Oliveira David Araujo | 2003 | POR Associacao Desportiva De Fafe | 01'28''27 | 202 |
| | Ribeiro Luis Manuel | 2002 | POR Futebol Clube Do Porto | Squalificato | |
