| 1 | Fernandes Ines Camacho | 1997 | POR Sporting Clube De Portugal | 01'01''58 | 731 |  |  | |
50m 28.79 (28.79) 100m 1:01.58 (32.79) [1:01.58] |
| 2 | Azevedo Francisca Gomes | 1997 | POR Sport Alges E Dafundo | 01'04''04 | 650 | | | |
50m 29.61 (29.61) 100m 1:04.04 (34.43) [1:04.04] |
| 3 | Cunha Mariana Pacheco | 2004 | POR Clube Fluvial Portuense | 01'04''11 | 648 | | | |
50m 29.84 (29.84) 100m 1:04.11 (34.27) [1:04.11] |
| 4 | Rodrigues Ana Margarida | 1996 | POR Clube Galitos De Aveiro | 01'04''12 | 647 | | | |
50m 29.65 (29.65) 100m 1:04.12 (34.47) [1:04.12] |
| 5 | Machado Madalena Amaro | 1998 | POR Clube Fluvial Portuense | 01'04''35 | 640 | | | |
50m 30.60 (30.60) 100m 1:04.35 (33.75) [1:04.35] |
| 6 | Cabral Maria Francisca | 2000 | POR Futebol Clube Do Porto | 01'04''48 | 636 | | | |
50m 30.58 (30.58) 100m 1:04.48 (33.90) [1:04.48] |
| 7 | Vargas Giovanna Vaz | 2000 | POR Desportivo Nautico Da Marinha Grande | 01'04''68 | 631 | | | |
50m 30.13 (30.13) 100m 1:04.68 (34.55) [1:04.68] |
| 8 | Graveto Ana Raquel | 2002 | POR Sport Lisboa E Benfica | 01'04''77 | 628 | | | |
50m 30.64 (30.64) 100m 1:04.77 (34.13) [1:04.77] |
| 9 | Barbosa Mariana Fernandes | 2002 | POR Futebol Clube Do Porto | 01'05''05 | 620 | | | |
50m 30.73 (30.73) 100m 1:05.05 (34.32) [1:05.05] |
| 10 | Pereira Ana Beatriz | 1991 | POR Clube De Futebol Os Belenenses | 01'05''09 | 619 | | | |
50m 30.14 (30.14) 100m 1:05.09 (34.95) [1:05.09] |
| 11 | Fernandes Leonor Camacho | 2002 | POR Sporting Clube De Portugal | 01'05''23 | 615 | | | |
50m 29.79 (29.79) 100m 1:05.23 (35.44) [1:05.23] |
| 12 | Rodrigues Sanchez Seco Laura | 2000 | POR Clube De Futebol Os Belenenses | 01'05''43 | 609 | | | |
50m 30.35 (30.35) 100m 1:05.43 (35.08) [1:05.43] |
| 13 | Goyanes Garcia Carla | 2001 | POR Escola Desportiva De Viana | 01'05''54 | 606 | | | |
50m 30.75 (30.75) 100m 1:05.54 (34.79) [1:05.54] |
| 14 | Barata Barbara Sofia | 1997 | POR Sport Alges E Dafundo | 01'06''09 | 591 | | | |
50m 30.35 (30.35) 100m 1:06.09 (35.74) [1:06.09] |
| 15 | Fernandes Carolina Miranda | 2005 | POR Clube Galitos De Aveiro | 01'06''23 | 587 | | | |
50m 31.94 (31.94) 100m 1:06.23 (34.29) [1:06.23] |
| 16 | Nobrega Ana Sofia | 1990 | POR Ginasio Clube De Vila Real | 01'06''71 | 575 | | | |
50m 31.31 (31.31) 100m 1:06.71 (35.40) [1:06.71] |
| 17 | Martins Joana Ribeiro | 2003 | POR Sport Lisboa E Benfica | 01'07''02 | 567 | | | |
50m 31.19 (31.19) 100m 1:07.02 (35.83) [1:07.02] |
| 18 | Silva Maria Madalena | 1998 | POR Sporting Clube De Braga | 01'07''09 | 565 | | | |
50m 32.34 (32.34) 100m 1:07.09 (34.75) [1:07.09] |
| 19 | Simoes Bruna Andreia | 2001 | POR Desportivo Nautico Da Marinha Grande | 01'08''57 | 529 | | | |
50m 31.00 (31.00) 100m 1:08.57 (37.57) [1:08.57] |
| 20 | Vaz Lara Alexandra | 1999 | POR Escola Desportiva De Viana | 01'10''06 | 496 | | | |
50m 32.73 (32.73) 100m 1:10.06 (37.33) [1:10.06] |
| 21 | Fernandes Maria Margarida | 1999 | POR Ginasio Clube De Vila Real | 01'10''85 | 480 | | | |
50m 32.64 (32.64) 100m 1:10.85 (38.21) [1:10.85] |
| 22 | Barros Margarida Cunha | 2002 | POR Sociedade Filarmonica Uniao Artistica Piedense | 01'12''47 | 448 | | | |
50m 33.52 (33.52) 100m 1:12.47 (38.95) [1:12.47] |
| 23 | Silva Ana Ramalho | 2001 | POR Sporting Clube De Braga | 01'14''05 | 420 | | | |
50m 34.03 (34.03) 100m 1:14.05 (40.02) [1:14.05] |
| 24 | Almeida Ines Vieira | 1999 | POR Sociedade Filarmonica Uniao Artistica Piedense | 01'17''14 | 372 | | | |
50m 34.91 (34.91) 100m 1:17.14 (42.23) [1:17.14] |
