| 1 | Goncalves Vera Andrade | 2009 | POR Juventude Atlantico Clube | 01'08''00 | 603 |  |  | |
50m 32.60 (32.60) 100m 1:08.00 (35.40) [1:08.00] |
| 2 | Clara Beatriz Belo | 2009 | POR Clube Nautico De Leiria | 01'08''71 | 584 | | | |
50m 32.81 (32.81) 100m 1:08.71 (35.90) [1:08.71] |
| 3 | Fialho Matilde Lopes | 2009 | POR Palmela Desporto Eem | 01'09''09 | 574 | | | |
50m 33.44 (33.44) 100m 1:09.09 (35.65) [1:09.09] |
| 4 | Baptista Carolina Sofia | 2009 | POR Estarreja/Prozinco | 01'09''44 | 566 | | | |
50m 33.42 (33.42) 100m 1:09.44 (36.02) [1:09.44] |
| 5 | Ribeiro Ines Carvalhinho | 2009 | POR Clube De Natacao Da Maia | 01'10''36 | 544 | | | |
50m 34.03 (34.03) 100m 1:10.36 (36.33) [1:10.36] |
| 6 | Santos Joana Almeida | 2009 | POR Clube Galitos De Aveiro | 01'11''35 | 522 | | | |
50m 35.18 (35.18) 100m 1:11.35 (36.17) [1:11.35] |
| 7 | Costa Leonor Martins | 2009 | POR Clube Natacao De Lagos | 01'11''66 | 515 | | | |
50m 33.87 (33.87) 100m 1:11.66 (37.79) [1:11.66] |
| 8 | Matias Alana Costa | 2009 | POR Clube Uniao 1919 | 01'11''68 | 514 | | | |
50m 34.20 (34.20) 100m 1:11.68 (37.48) [1:11.68] |
| 9 | Cavaleiro Leonor Merces | 2009 | POR Associacao Columbofila Cantanhedense | 01'11''82 | 511 | | | |
50m 34.32 (34.32) 100m 1:11.82 (37.50) [1:11.82] |
| 10 | Galante Filipa Carvalho | 2009 | POR Clube Fluvial Vilacondense | 01'12''29 | 501 | | | |
50m 34.67 (34.67) 100m 1:12.29 (37.62) [1:12.29] |
| 11 | Santos Ines Sousa | 2009 | POR Clube Fluvial Vilacondense | 01'12''58 | 495 | | | |
50m 34.73 (34.73) 100m 1:12.58 (37.85) [1:12.58] |
| 12 | Novais Mariana Silvestre | 2009 | POR Portinado-Assoc Natacao De Portimao | 01'12''76 | 492 | | | |
50m 34.04 (34.04) 100m 1:12.76 (38.72) [1:12.76] |
| 13 | Antunes Ana Moreira | 2009 | POR Grupo Desportivo De Natacao De Vila Nova De Famalicao | 01'12''77 | 492 | | | |
50m 34.38 (34.38) 100m 1:12.77 (38.39) [1:12.77] |
| 14 | Santos Caetana Amado | 2009 | POR Clube Nautico De Miranda Do Corvo | 01'12''87 | 490 | | | |
50m 35.38 (35.38) 100m 1:12.87 (37.49) [1:12.87] |
| 15 | Magalhaes Matilde Esteves | 2009 | POR Sporting Clube Caminhense | 01'13''45 | 478 | | | |
50m 35.12 (35.12) 100m 1:13.45 (38.33) [1:13.45] |
| 16 | Ricardo Francisca Martingo | 2009 | POR Futebol Clube Do Porto | 01'13''49 | 477 | | | |
50m 35.42 (35.42) 100m 1:13.49 (38.07) [1:13.49] |
| 17 | Castro Marta Antunes | 2009 | POR Sporting Clube De Aveiro | 01'13''78 | 472 | | | |
50m 35.21 (35.21) 100m 1:13.78 (38.57) [1:13.78] |
| 18 | Calcada Maria Leonor | 2009 | POR Sporting Clube De Portugal | 01'14''95 | 450 | | | |
50m 35.61 (35.61) 100m 1:14.95 (39.34) [1:14.95] |
