| 1 | Bernardino Mafalda Varela | 2012 | POR Clube De Natacao De Alcobaca | 01'40''01 | 242 |  |  | |
50m 48.11 (48.11) 100m 1:40.01 (51.90) [1:40.01] |
| 2 | Varela Laura Krempel | 2012 | POR Sociedade Instrucao E Recreio Os Pimpoes/Cimai | 01'44''15 | 214 | | | |
50m 49.56 (49.56) 100m 1:44.15 (54.59) [1:44.15] |
| 3 | Saraiva Emiliana Arruda | 2012 | POR Industrial Desportivo Vieirense | 01'46''43 | 201 | | | |
50m 50.86 (50.86) 100m 1:46.43 (55.57) [1:46.43] |
| 4 | Felix Benedita Nunes | 2012 | POR Obidos Criativa, Eem | 01'47''89 | 193 | | | |
50m 51.44 (51.44) 100m 1:47.89 (56.45) [1:47.89] |
| 5 | Ferreira Daniela Carvalho | 2012 | POR Nucleo Desporto Amador De Pombal | 01'52''68 | 169 | | | |
50m 53.35 (53.35) 100m 1:52.68 (59.33) [1:52.68] |
| 6 | Andre Carminho Traquina | 2012 | POR Clube De Natacao De Alcobaca | 01'53''03 | 167 | | | |
50m 53.75 (53.75) 100m 1:53.03 (59.28) [1:53.03] |
| 7 | Avramescu Emma Maria | 2012 | POR Desportivo Nautico Da Marinha Grande | 01'53''65 | 165 | | | |
50m 52.10 (52.10) 100m 1:53.65 (1:01.55) [1:53.65] |
| 8 | Pereira Luna Francisco | 2012 | POR Nucleo Desporto Amador De Pombal | 01'55''03 | 159 | | | |
50m 54.78 (54.78) 100m 1:55.03 (1:00.25) [1:55.03] |
| 9 | Pinheiro Julia Pinto | 2012 | POR Sociedade Instrucao E Recreio Os Pimpoes/Cimai | 01'57''37 | 149 | | | |
50m 56.92 (56.92) 100m 1:57.37 (1:00.45) [1:57.37] |
| 10 | Martins Ines Pinto | 2012 | POR Sociedade Instrucao E Recreio Os Pimpoes/Cimai | 01'58''60 | 145 | | | |
50m 57.18 (57.18) 100m 1:58.60 (1:01.42) [1:58.60] |
| 11 | Tabunschyk Yaroslava | 2012 | POR Clube Nautico De Leiria | 02'01''50 | 135 | | | |
50m 57.90 (57.90) 100m 2:01.50 (1:03.60) [2:01.50] |
| 12 | Jordao Rita Alexandra | 2012 | POR Uniao Recreativa Desportiva Juncalense | 02'03''54 | 128 | | | |
50m 59.40 (59.40) 100m 2:03.54 (1:04.14) [2:03.54] |
| 13 | Pacheco Maria Victoria | 2012 | POR Clube De Natacao De Alcobaca | 02'06''96 | 118 | | | |
50m 1:01.71 (1:01.71) 100m 2:06.96 (1:05.25) [2:06.96] |
| 14 | Correia Carolina Matos | 2012 | POR Nucleo Desporto Amador De Pombal | 02'08''26 | 114 | | | |
50m 1:00.62 (1:00.62) 100m 2:08.26 (1:07.64) [2:08.26] |
| 15 | Ferreira Jessica Garcia | 2012 | POR Obidos Criativa, Eem | 02'09''35 | 112 | | | |
50m 1:01.93 (1:01.93) 100m 2:09.35 (1:07.42) [2:09.35] |
| 16 | Gomes Maria Ines | 2012 | POR Nucleo Desporto Amador De Pombal | 02'10''72 | 108 | | | |
50m 1:00.46 (1:00.46) 100m 2:10.72 (1:10.26) [2:10.72] |
| 17 | Coutinho Constanca Santos | 2012 | POR Clube Naval Da Nazare | 02'11''12 | 107 | | | |
50m 1:01.28 (1:01.28) 100m 2:11.12 (1:09.84) [2:11.12] |
| | Simoes Bruna Lopes | 2012 | POR Nucleo Desportivo De Ansiao | Squalificato | |
