| 1 | Santos Pedro Andre | 1994 | POR Sport Alges E Dafundo | 00'25''11 | 649 |
| 2 | Chacon Mateos Francisco Javier | 1999 | ESP C.N. Alcala | 00'25''13 | 648 |
| 3 | Carvalho Diogo Filipe | 1988 | POR Clube Galitos De Aveiro | 00'25''44 | 624 |
| 4 | Nascimento Miguel Duarte | 1995 | POR Sport Lisboa E Benfica | 00'25''45 | 624 |
| 5 | Garcia Rafael Pablo | 1999 | POR Louletano Desportos Clube | 00'25''63 | 611 |
| 6 | Gil De Eraso Francisco Saul | 1998 | ESP CN Mairena del Aljarafe | 00'25''64 | 610 |
| 7 | Vakulyuk Paulo | 2003 | POR Clube De Natacao De Torres Novas | 00'25''73 | 604 |
| 8 | Francisco Daniel Sebastiao | 2000 | POR Sport Lisboa E Benfica | 00'25''74 | 603 |
| 9 | Cantos Galvez Manuel Jesus | 1997 | POR Louletano Desportos Clube | 00'25''82 | 597 |
| 10 | Marques Miguel Henriques | 2000 | POR Sport Lisboa E Benfica | 00'25''88 | 593 |
| 11 | Balaguer Umsari Daniel | 1994 | ESP CN Mairena del Aljarafe | 00'25''92 | 590 |
| 12 | Moreno Lara Antonio | 2002 | ESP Andalucia | 00'25''98 | 586 |
| 13 | Jaime Crehuet Jose Maria | 2001 | ESP CN Mairena del Aljarafe | 00'26''07 | 580 |
| 14 | Sequeira Duarte Nunes | 2002 | POR Clube Natacao De Lagos | 00'26''52 | 551 |
| 15 | Alfama Martim Primavera | 2002 | POR Gesloures-Gestao Equip. Sociais, Em | 00'26''57 | 548 |
| 16 | Moyano Lazo Jaime | 1999 | ESP C.n. Lucena | 00'26''59 | 547 |
| 17 | Junior Luis Cabral | 2003 | POR Clube De Futebol Os Belenenses | 00'26''78 | 535 |
| 18 | Bohorquez Huertas Juan Carlos | 2002 | ESP Utrera | 00'26''91 | 528 |
| 19 | Lopes Carlos Filipe | 2001 | POR Sociedade Filarmonica Uniao Artistica Piedense | 00'26''93 | 526 |
| 20 | Machado Tiago Andrade | 2002 | POR Clube Galitos De Aveiro | 00'27''04 | 520 |
| 21 | Santos Joao Duarte | 1995 | POR Clube Natacao De Olhao | 00'27''06 | 519 |
| 22 | Grenho Andre Tavares | 1999 | POR Gesloures-Gestao Equip. Sociais, Em | 00'27''10 | 516 |
| 23 | Kondratenko Antonio | 2001 | POR Portinado-Assoc Natacao De Portimao | 00'27''17 | 512 |
| 24 | Nova Tiago Vila | 2000 | POR Portinado-Assoc Natacao De Portimao | 00'27''42 | 499 |
| 25 | Marin Daniel | 2002 | POR Futebol Clube Ferreiras | 00'27''45 | 497 |
| | Santos Edgar Filipe | 2001 | POR Sociedade Filarmonica Uniao Artistica Piedense | 00'27''45 | 497 |
| 27 | Zinca Andrei Iulian | 2000 | POR Assoc Pais Amigos Criancas Gafanha Da Encarnacao | 00'27''48 | 495 |
| | Tavares Bernardo Rodrigues | 2004 | POR Clube Galitos De Aveiro | 00'27''48 | 495 |
| 29 | Rivas Yuste Alejandro | 1996 | ESP Utrera | 00'27''59 | 489 |
| 30 | Martyn David | 2003 | POR Benedita Sport Club Natacao | 00'27''67 | 485 |
| 31 | Estepa Monroy Pablo | 2002 | ESP CN Mairena del Aljarafe | 00'27''82 | 477 |
| 32 | Mestre Afonso Gomes | 2003 | POR Louletano Desportos Clube | 00'28''10 | 463 |
| 33 | Boto Pedro Alexandre | 2002 | POR Clube De Natacao Do Litoral Alentejano | 00'28''12 | 462 |
| 34 | Soldado Carmona Ignacio | 2002 | ESP CN Mairena del Aljarafe | 00'28''27 | 455 |
| 35 | Ferreira Antonio Maria | 2000 | POR Palmela Desporto Eem | 00'28''29 | 454 |
| 36 | Venegas Alonso Placido Antonio | 1997 | ESP Utrera | 00'28''30 | 453 |
| | Goncalves Jose Luis | 2005 | POR Portugal | 00'28''30 | 453 |
| 38 | Pereira Henrique Saraiva | 2003 | POR Portinado-Assoc Natacao De Portimao | 00'28''41 | 448 |
| 39 | Cardoso Guilherme Dias | 2003 | POR Futebol Clube Ferreiras | 00'28''44 | 447 |
| 40 | Lozano Espejo Javier | 2005 | ESP Andalucia | 00'28''75 | 432 |
| 41 | Santos Afonso Amaro | 2002 | POR Gesloures-Gestao Equip. Sociais, Em | 00'28''81 | 430 |
| 42 | Bonanca Diogo Osorio | 2001 | POR Clube De Natacao De Faro | 00'30''28 | 370 |
| 43 | Borisov Iuri Lucas | 2004 | POR Louletano Desportos Clube | 00'30''89 | 349 |
