| 1 | Santos Francisco Rogerio | 1998 | POR Sporting Clube De Portugal | 00'25''75 | 642 |
| 2 | Manacas Silva Santos Alexis | 1992 | POR Sporting Clube De Portugal | 00'25''93 | 629 |
| 3 | Souza Da Silva Fernando | 1986 | POR Sociedade Filarmonica Uniao Artistica Piedense | 00'26''11 | 616 |
| 4 | Alfama Martim Primavera | 2002 | POR Gesloures-Gestao Equip. Sociais, Em | 00'26''13 | 614 |
| 5 | Rueda Narvaez Alejandro | 2002 | ESP Andalucia | 00'26''49 | 590 |
| 6 | Dantas Diogo Leal | 2000 | POR Sporting Clube De Portugal | 00'26''72 | 575 |
| 7 | Nascimento Miguel Duarte | 1995 | POR Sport Lisboa E Benfica | 00'26''81 | 569 |
| 8 | Garcia Rafael Pablo | 1999 | POR Louletano Desportos Clube | 00'27''77 | 512 |
| 9 | Alarcon Salas Francisco | 1999 | ESP CN Mairena del Aljarafe | 00'27''90 | 505 |
| 10 | Galindo Flores Jesus | 2003 | ESP C.N. Alcala | 00'27''92 | 504 |
| 11 | Marques Miguel Henriques | 2000 | POR Sport Lisboa E Benfica | 00'27''96 | 501 |
| 12 | Araujo Diogo Alexandre | 2001 | POR Clube Desportivo Olivais E Moscavide | 00'28''22 | 488 |
| 13 | Pulido Peguero Daniel | 2005 | ESP Andalucia | 00'28''30 | 484 |
| 14 | Silva Ricardo Lopes | 2003 | POR Desportivo Nautico Da Marinha Grande | 00'28''49 | 474 |
| 15 | Ferreira Ricardo Pinela | 2001 | POR Sport Lisboa E Benfica | 00'28''54 | 471 |
| 16 | Fonseca Luis Filipe | 1997 | POR Clube Futebol De Estremoz | 00'28''61 | 468 |
| 17 | Folia Jimenez Francisco | 2000 | ESP CN Mairena del Aljarafe | 00'28''84 | 457 |
| 18 | Zinca Andrei Iulian | 2000 | POR Assoc Pais Amigos Criancas Gafanha Da Encarnacao | 00'28''90 | 454 |
| 19 | Magalhaes Hugo Nunes | 2002 | POR Sport Alges E Dafundo | 00'29''02 | 448 |
| 20 | Pimentel Alfredo Eugenio | 2000 | POR Clube De Natacao Do Litoral Alentejano | 00'29''06 | 447 |
| 21 | Jaenes Daniel Sanchez | 1997 | ESP CN Mairena del Aljarafe | 00'29''26 | 437 |
| 22 | Santos Edgar Filipe | 2001 | POR Sociedade Filarmonica Uniao Artistica Piedense | 00'29''35 | 433 |
| 23 | Alcantarilla Romero Jaime | 2003 | ESP CN Mairena del Aljarafe | 00'29''37 | 433 |
| 24 | Gomes Diogo Sousa | 2002 | POR Portinado-Assoc Natacao De Portimao | 00'29''38 | 432 |
| 25 | Oliveira Cesar Goncalves | 2000 | POR Futebol Clube Ferreiras | 00'29''41 | 431 |
| 26 | Casaus Riveriego Jose Antonio | 2003 | ESP Utrera | 00'29''42 | 430 |
| 27 | Santos Miguel Alexandre | 2003 | POR Clube Natacao De Olhao | 00'29''44 | 429 |
| 28 | Faria Ricardo Morais | 2004 | POR Associacao Desportiva Bairro Dos Anjos /Bomcar | 00'29''64 | 421 |
| 29 | Perez Barroso Eduardo | 2002 | POR Clube Nautico Do Guadiana | 00'29''68 | 419 |
| 30 | Simoes Miguel Costa | 2004 | POR Clube Desportivo Cova Da Piedade | 00'29''82 | 413 |
| 31 | Torres Navarro Pablo | 2000 | ESP Utrera | 00'29''87 | 411 |
| 32 | Camoes Tiago Maria | 2001 | POR Sociedade Filarmonica Uniao Artistica Piedense | 00'29''89 | 410 |
| 33 | Mir Macias Joaquin | 2003 | ESP C.n. Colombino | 00'29''91 | 409 |
| 34 | Fonseca Leandro Dinis | 2002 | POR Clube Natacao De Lagos | 00'29''92 | 409 |
| 35 | Conesa Diaz Alejandro | 2000 | ESP CN Mairena del Aljarafe | 00'30''51 | 386 |
| | Rivero Gallardo Alejandro | 2000 | POR Clube Nautico Do Guadiana | 00'30''51 | 386 |
| 37 | Martins Henrique Antonio | 2003 | POR Clube De Natacao Do Tejo | 00'30''66 | 380 |
| 38 | Cardoso Filipe Santos | 2004 | POR Assoc Pais Amigos Criancas Gafanha Da Encarnacao | 00'30''67 | 380 |
| 39 | Kondratenko Antonio | 2001 | POR Portinado-Assoc Natacao De Portimao | 00'30''70 | 379 |
| 40 | Costa Alexandre Afonso | 2003 | POR Louletano Desportos Clube | 00'31''88 | 338 |
| 41 | Frois Andre Filipe | 2002 | POR Clube Futebol De Estremoz | 00'32''42 | 321 |
| 42 | Chaveiro Francisco Martins | 2002 | POR Portinado-Assoc Natacao De Portimao | 00'33''11 | 302 |
