| 1 | Gomes Goncalo Matos | 2009 | POR Clube Aquatico Pacense | 00'39''97 | 130 |
| 2 | Macedo Martim Cunha | 2009 | POR Clube De Natacao Da Maia | 00'41''13 | 119 |
| 3 | Cunha Cristiano Alexandre | 2009 | POR Clube Aquatico Pacense | 00'41''64 | 115 |
| 4 | Vicente Emanuel David | 2009 | POR Colegio Luso-Internacional Do Porto | 00'43''29 | 102 |
| 5 | Leite Francisco Almeida | 2009 | POR Colegio Luso-Internacional Do Porto | 00'43''69 | 99 |
| 6 | Fangueiro Pedro Ramos | 2009 | POR Clube Fluvial Vilacondense | 00'44''42 | 94 |
| 7 | Ferreira Andre Bernardes | 2009 | POR Clube Fluvial Portuense | 00'44''67 | 93 |
| 8 | Lobo Henrique Goncalves | 2009 | POR Grupo Desportivo De Natacao De Vila Nova De Famalicao | 00'44''89 | 91 |
| 9 | Sampaio Rafael Rui | 2009 | POR Grupo Desportivo De Natacao De Vila Nova De Famalicao | 00'45''10 | 90 |
| 10 | Martins Tiago Miguel | 2009 | POR Grupo Desportivo De Natacao De Vila Nova De Famalicao | 00'45''57 | 87 |
| 11 | Martinho Vasco Jorge | 2009 | POR Clube Fluvial Portuense | 00'45''64 | 87 |
| 12 | Bento Antonio Miguel | 2009 | POR Clube Fluvial Vilacondense | 00'45''65 | 87 |
| 13 | Barros Tomas Pinto | 2009 | POR Clube De Natacao Da Maia | 00'45''79 | 86 |
| | Freitas Diogo Miguel | 2009 | POR Associacao Desportiva De Fafe | 00'45''79 | 86 |
| 15 | Pinto Henrique Sousa | 2009 | POR Clube De Natacao Da Maia | 00'45''89 | 86 |
| 16 | Pereira Rafael Fragoso | 2009 | POR Futebol Clube Do Porto | 00'47''29 | 78 |
| 17 | Deus Bernardo Silva | 2009 | POR Clube Fluvial Portuense | 00'47''80 | 76 |
| 18 | Gaiteiro Ruben Andre | 2009 | POR Clube De Natacao Da Maia | 00'48''02 | 75 |
| 19 | Silva Rafael Aguiar | 2009 | POR Associacao Desportiva De Fafe | 00'48''59 | 72 |
| 20 | Varela Miguel Castro | 2009 | POR Associacao Desportiva De Fafe | 00'48''95 | 70 |
| 21 | Demarzo Matteo Furlan | 2009 | POR Colegio Luso-Internacional Do Porto | 00'49''21 | 69 |
| 22 | Ferraz Nuno Henrique | 2009 | POR Clube De Natacao De Valongo | 00'49''76 | 67 |
| 23 | Anjos Guilherme Neto | 2009 | POR Clube Fluvial Portuense | 00'49''82 | 67 |
| 24 | Torres Joao Pedro | 2009 | POR Clube Naval Povoense | 00'50''20 | 65 |
| 25 | Gomes Castro Antonio | 2009 | POR Clube Fluvial Vilacondense | 00'50''29 | 65 |
| 26 | Jesus Ricardo Jorge | 2009 | POR Leixoes Sport Club | 00'50''92 | 62 |
| 27 | Duarte Pedro Afonso | 2009 | POR Leixoes Sport Club | 00'51''36 | 61 |
| 28 | Rodrigues Goncalo Fonseca | 2009 | POR Clube De Natacao De Valongo | 00'51''42 | 61 |
| 29 | Ferreira Pedro Guedes | 2009 | POR Futebol Clube Do Porto | 00'52''41 | 57 |
| 30 | Sottomayor Luis Maria | 2009 | POR Clube Fluvial Portuense | 00'53''64 | 53 |
| 31 | Rodrigues Afonso Silva | 2009 | POR Clube Naval Povoense | 00'54''32 | 51 |
| 32 | Costa Miguel Angelo | 2009 | POR Clube Propaganda Da Natacao | 00'57''14 | 44 |
| 33 | Mendes Rubim Dinis | 2009 | POR Clube Fluvial Portuense | 00'58''20 | 42 |
| 34 | Fernandes Miguel Serra | 2009 | POR Clube Naval Povoense | 00'59''16 | 40 |
| 35 | Carvalho Tomas Pinto | 2009 | POR Clube Fluvial Portuense | 01'00''52 | 37 |
| 36 | Silva Rodrigo Oliveira | 2008 | POR Grupo Desportivo De Natacao De Vila Nova De Famalicao | 01'02''04 | 34 |
