| 1 | Almeida Lopes Gabriel Jose | 1997 | POR Associacao Louzan Natacao | 00'57''14 | 747 |
| 2 | Da Graca Antunes Lopes Jose Paulo | 2000 | POR Sporting Clube De Braga | 00'59''53 | 660 |
| 3 | Rocha Ricardo Filipe | 2002 | POR Portugal | 00'59''76 | 653 |
| 4 | Santos Costa Diogo | 2002 | POR Portugal | 01'00''30 | 635 |
| 5 | Valentin Olivares Pablo | 2001 | ESP Federacion Castilla La Mancha | 01'00''37 | 633 |
| 6 | Ribeiro Ivo Pinto | 1997 | POR Foca-Clube Natacao De Felgueiras | 01'01''16 | 609 |
| 7 | Laranjeira Joao Jose | 1998 | POR Clube Galitos De Aveiro | 01'01''35 | 603 |
| 8 | Arzileiro Bernardo Vinagre | 2001 | POR Clube Uniao 1919 | 01'02''19 | 579 |
| 9 | Beltran Cabedo Pau | 1993 | ESP Federacion Castilla La Mancha | 01'02''20 | 579 |
| 10 | Correia Joao Mota | 1997 | POR Sport Lisboa E Benfica | 01'02''45 | 572 |
| 11 | Pinho Manuel Antonio | 2001 | POR Clube Desportivo Feirense | 01'02''50 | 570 |
| 12 | Zinca Andrei Iulian | 2000 | POR Assoc Pais Amigos Criancas Gafanha Da Encarnacao | 01'02''72 | 564 |
| 13 | Silva Job Santos | 1996 | POR Clube Desportivo Feirense | 01'02''81 | 562 |
| 14 | Castro Duarte Monteiro | 2003 | POR Futebol Clube Do Porto | 01'03''12 | 554 |
| 15 | Bastos Lucas Pereira | 2000 | POR Clube Nautico Academico/Urgicentro-Sanfil | 01'03''25 | 550 |
| 16 | Gomes Tomas Nogueira | 2003 | POR Sociedade Filarmonica Uniao Artistica Piedense | 01'03''63 | 541 |
| 17 | Alfama Martim Primavera | 2002 | POR Gesloures-Gestao Equip. Sociais, Em | 01'03''72 | 538 |
| 18 | Dias Joao Pedro | 2002 | POR Fundacao Beatriz Santos-Clube | 01'03''78 | 537 |
| 19 | Fernandes Rui Afonso | 2003 | POR Seleccao Da Madeira | 01'04''41 | 521 |
| 20 | Silva Rodrigo Reis | 1998 | POR Colegio Liceal De Santa Maria De Lamas | 01'04''93 | 509 |
| 21 | Santos Edgar Filipe | 2001 | POR Sociedade Filarmonica Uniao Artistica Piedense | 01'05''33 | 499 |
| 22 | Coelho Rodrigo Manuel | 2001 | POR Clube Desportivo Feirense | 01'05''54 | 495 |
| 23 | Agostinho Miguel Diogo | 2000 | POR Fundacao Beatriz Santos-Clube | 01'06''85 | 466 |
| 24 | Veloso Tomas Miguel | 1996 | POR Clube Nautico Academico/Urgicentro-Sanfil | 01'06''98 | 463 |
| 25 | Gomes Diogo Sousa | 2002 | POR Portinado-Assoc Natacao De Portimao | 01'07''19 | 459 |
| 26 | Ferrao Goncalo Carvalho | 2001 | POR Clube Desportivo Cova Da Piedade | 01'08''63 | 431 |
| 27 | Meneses Marco Ribeiro | 2001 | POR Academia Cult Rec Concelho Castro Daire | 01'15''05 | 329 |
| 28 | Reis Bruno Ferreira | 2000 | POR Feira Viva Cultura E Desporto | 01'31''97 | 179 |
