| 1 | Rebelo Joao Lourenco | 2004 | POR Sport Alges E Dafundo | 02'24''41 | 576 |  |  | |
50m 32.94 (32.94) 100m 1:09.50 (36.56) [1:09.50] 200m 2:24.41 [1:14.91] |
| 2 | Alves Paulo Rodrigues | 2004 | POR Clube Desportivo Nacional | 02'24''48 | 575 | | | |
50m 34.20 (34.20) 100m 1:09.69 (35.49) [1:09.69] 200m 2:24.48 [1:14.79] |
| 3 | Fernandes Martim Pestana | 2004 | POR Clube Naval Do Funchal | 02'27''85 | 536 | | | |
50m 33.20 (33.20) 100m 1:11.14 (37.94) [1:11.14] 200m 2:27.85 [1:16.71] |
| 4 | Carvalho Antonio Lombardi | 2004 | POR Sporting Clube De Portugal | 02'30''19 | 512 | | | |
50m 33.63 (33.63) 100m 1:11.18 (37.55) [1:11.18] 200m 2:30.19 [1:19.01] |
| 5 | Farias Alexandre Moreira | 2004 | POR Louletano Desportos Clube | 02'31''45 | 499 | | | |
50m 33.72 (33.72) 100m 1:12.23 (38.51) [1:12.23] 200m 2:31.45 [1:19.22] |
| 6 | Aniceto Joao Gabriel | 2004 | POR Associacao Desportiva Bairro Dos Anjos /Bomcar | 02'31''64 | 497 | | | |
50m 33.67 (33.67) 100m 1:12.14 (38.47) [1:12.14] 200m 2:31.64 [1:19.50] |
| 7 | Lopes Francisco Oliveira | 2004 | POR Clube Act Fisica Bomb. De Ponta Delgada | 02'31''75 | 496 | | | |
50m 34.15 (34.15) 100m 1:12.50 (38.35) [1:12.50] 200m 2:31.75 [1:19.25] |
| 8 | Chocas Afonso Alves | 2004 | POR Electrico Futebol Clube De Ponte De Sor | 02'32''53 | 488 | | | |
50m 33.74 (33.74) 100m 1:13.29 (39.55) [1:13.29] 200m 2:32.53 [1:19.24] |
| 9 | Goncalves Duarte Cadima | 2004 | POR Clube Natacao Do Montijo | 02'35''95 | 457 | | | |
50m 35.70 (35.70) 100m 1:16.23 (40.53) [1:16.23] 200m 2:35.95 [1:19.72] |
| 10 | Lopes Tiago Fanha | 2004 | POR Clube Natacao Do Montijo | 02'36''55 | 452 | | | |
50m 35.77 (35.77) 100m 1:16.11 (40.34) [1:16.11] 200m 2:36.55 [1:20.44] |
| 11 | Jorge Afonso Goncalves De | 2004 | POR Gesloures-Gestao Equip. Sociais, Em | 02'36''76 | 450 | | | |
50m 34.98 (34.98) 100m 1:15.06 (40.08) [1:15.06] 200m 2:36.76 [1:21.70] |
| 12 | Vieira Tomas Sa | 2004 | POR Sport Alges E Dafundo | 02'37''49 | 444 | | | |
50m 34.92 (34.92) 100m 1:15.20 (40.28) [1:15.20] 200m 2:37.49 [1:22.29] |
| 13 | Nunes Jaeden Michael | 2004 | POR Clube De Futebol Os Belenenses | 02'38''17 | 438 | | | |
50m 35.48 (35.48) 100m 1:15.98 (40.50) [1:15.98] 200m 2:38.17 [1:22.19] |
| 14 | Oliveira Vasco Peixoto | 2004 | POR Clube De Natacao De Alcobaca | 02'38''99 | 431 | | | |
50m 35.22 (35.22) 100m 1:15.78 (40.56) [1:15.78] 200m 2:38.99 [1:23.21] |
| 15 | Matias Francisco Miguel | 2004 | POR Ccd Pess. Camara Munic. Da Serta | 02'42''56 | 403 | | | |
50m 34.95 (34.95) 100m 1:15.65 (40.70) [1:15.65] 200m 2:42.56 [1:26.91] |
| 16 | Tristao Miguel Salomao | 2004 | POR Portinado-Assoc Natacao De Portimao | 02'43''39 | 397 | | | |
50m 36.11 (36.11) 100m 1:17.19 (41.08) [1:17.19] 200m 2:43.39 [1:26.20] |
