| 1 | Fernandes Pedro Miguel | 1999 | POR Grupo Desportivo De Natacao De Vila Nova De Famalicao | 00'25''52 | 664 |
| 2 | Sampaio Jose Pedro | 1998 | POR Clube Fluvial Portuense | 00'26''44 | 597 |
| 3 | Lourenco Tiago Campos | 2002 | POR Clube De Natacao De Valongo | 00'26''79 | 574 |
| 4 | Ramos Filipe Carmo | 1997 | POR Clube Fluvial Vilacondense | 00'26''81 | 573 |
| 5 | Teodoro Diogo Filipe | 1999 | POR Clube De Natacao De Valongo | 00'27''10 | 554 |
| 6 | Tinoco Joao Pereira | 2000 | POR Grupo Desportivo De Natacao De Vila Nova De Famalicao | 00'27''27 | 544 |
| 7 | Lima David Dias | 2000 | POR Clube Fluvial Vilacondense | 00'27''31 | 542 |
| 8 | Lopes Tomas Teixeira | 2002 | POR Foca-Clube Natacao De Felgueiras | 00'27''49 | 531 |
| 9 | Almeida Luis Carlos | 1998 | POR Clube Aquatico Pacense | 00'27''55 | 528 |
| | Silva Joao Carlos | 1998 | POR Grupo Desportivo De Natacao De Vila Nova De Famalicao | 00'27''55 | 528 |
| 11 | Magalhaes Eduardo Miguel | 2002 | POR Vitoria Sport Clube/Olicargo | 00'27''70 | 519 |
| 12 | Silva Paulo Filipe | 1998 | POR Clube De Natacao Da Maia | 00'27''75 | 516 |
| 13 | Costa Afonso Vilhena | 2004 | POR Clube Fluvial Vilacondense | 00'27''86 | 510 |
| 14 | Morim Pedro Soares | 2002 | POR Clube Naval Povoense | 00'27''91 | 508 |
| 15 | Borges David Costa | 2004 | POR Clube Fluvial Portuense | 00'28''11 | 497 |
| 16 | Oliveira Rui Goncalves | 1993 | POR Clube De Natacao Da Maia | 00'28''16 | 494 |
| 17 | Oliveira Manuel Filipe | 2002 | POR Colegio Liceal De Santa Maria De Lamas | 00'28''23 | 490 |
| 18 | Maia Jorge Manuel | 1989 | POR Grupo Desportivo De Natacao De Vila Nova De Famalicao | 00'28''29 | 487 |
| 19 | Soares Luis Filipe | 1998 | POR Colegio Liceal De Santa Maria De Lamas | 00'28''36 | 484 |
| 20 | Martins Marcos Dias | 2002 | POR Colegio Liceal De Santa Maria De Lamas | 00'28''50 | 477 |
| 21 | Coentrao Diogo Silva | 2002 | POR Grupo Desportivo De Natacao De Vila Nova De Famalicao | 00'28''57 | 473 |
| 22 | Cruz Miguel Angelo | 1996 | POR Clube Aquatico Pacense | 00'28''61 | 471 |
| 23 | Peixoto Joao Freitas | 2001 | POR Associacao Desportiva De Fafe | 00'29''04 | 450 |
| 24 | Maia Bruno Miguel | 2001 | POR Ginasio Clube De Santo Tirso | 00'29''12 | 447 |
| 25 | Seixas Bruno Miguel | 2001 | POR Clube De Natacao Da Maia | 00'29''51 | 429 |
| 26 | Cardoso Diogo Gomes | 2002 | POR Colegio Liceal De Santa Maria De Lamas | 00'29''64 | 424 |
| 27 | Ribeiro Vitor Hugo | 2003 | POR Lousada Seculo XXI | 00'29''87 | 414 |
| 28 | Teixeira Leonardo Filipe | 2000 | POR Assoc. Propriet. Da Urbanizacao Vila De Este | 00'30''43 | 391 |
| 29 | Maia Rodrigo Costa | 2003 | POR Clube Fluvial Portuense | 00'30''44 | 391 |
| 30 | Goncalves Albino Manuel | 1999 | POR Associacao Desportiva De Fafe | 00'30''46 | 390 |
| 31 | Bessa Flavio Rafael | 2003 | POR Lousada Seculo XXI | 00'30''78 | 378 |
| 32 | Varela Mateus Castro | 2004 | POR Associacao Desportiva De Fafe | 00'30''96 | 372 |
| 33 | Costa Daniel Filipe | 2004 | POR Assoc. Propriet. Da Urbanizacao Vila De Este | 00'31''31 | 359 |
| 34 | Teixeira Goncalo Mauricio | 2003 | POR Amarantus Aquatic Club | 00'31''47 | 354 |
| 35 | Gomes Tiago Filipe | 2002 | POR Assoc. Propriet. Da Urbanizacao Vila De Este | 00'31''94 | 338 |
| 36 | Mendes Goncalo Costa | 2003 | POR Amarantus Aquatic Club | 00'32''00 | 337 |
| 37 | Sousa David Nunes | 1996 | POR Vitoria Sport Clube/Olicargo | 00'32''47 | 322 |
| 38 | Coelho Nuno Antonio | 2004 | POR Lousada Seculo XXI | 00'32''64 | 317 |
| 39 | Santos Guilherme Silva | 2003 | POR Associacao Desportiva De Penafiel | 00'32''91 | 309 |
| 40 | Soares Guilherme Dinis | 2004 | POR Amarantus Aquatic Club | 00'33''57 | 291 |
| 41 | Teixeira Manuel Fernando | 2004 | POR Clube De Natacao De Valongo | 00'35''12 | 254 |
| | Carvalho Mateus Ribeiro | 1999 | POR Grupo Desportivo De Natacao De Vila Nova De Famalicao | Squalificato | |
