| 1 | Kot Viktor | 1998 | POR Desportivo Nautico Da Marinha Grande | 00'24''44 | 626 |
| 2 | Carvalho Ruben Paiva | 1994 | POR Associacao Academica De Coimbra | 00'24''72 | 605 |
| 3 | Machado Tiago Andrade | 2002 | POR Sporting Clube De Aveiro | 00'24''90 | 592 |
| 4 | Agostinho Miguel Diogo | 2000 | POR Fundacao Beatriz Santos-Clube | 00'24''93 | 590 |
| 5 | Santos Nuno Goncalo | 1996 | POR Associacao Desportiva Bairro Dos Anjos /Bomcar | 00'24''94 | 589 |
| 6 | Gomes Rodrigo Ribeiro | 2000 | POR Fundacao Beatriz Santos-Clube | 00'25''22 | 569 |
| 7 | Pinho Manuel Antonio | 2001 | POR Clube Desportivo Feirense | 00'25''27 | 566 |
| 8 | Machado Ricardo Marques | 2002 | POR Academico Viseu Futebol Clube | 00'25''37 | 559 |
| 9 | Pelaio Jose Pedro | 2001 | POR Clube Galitos De Aveiro | 00'25''46 | 553 |
| 10 | Fidalgo Mateus Valente | 2001 | POR Clube Desportivo De Estarreja | 00'25''52 | 550 |
| 11 | Pereira Joao Neto | 2002 | POR Fundacao Beatriz Santos-Clube | 00'25''61 | 544 |
| | Carola Hugo Filipe | 2001 | POR Clube Galitos De Aveiro | 00'25''61 | 544 |
| 13 | Bastos Lucas Pereira | 2000 | POR Clube Nautico Academico/Urgicentro-Sanfil | 00'25''64 | 542 |
| 14 | Gomes Sebastiao Mendes | 2000 | POR Sociedade Instrucao E Recreio Os Pimpoes/Cimai | 00'25''65 | 541 |
| 15 | Costa Afonso Filipe | 2003 | POR Clube Naval Da Nazare | 00'25''71 | 537 |
| 16 | Machado Joao Francisco | 1999 | POR Clube Uniao 1919 | 00'25''79 | 532 |
| 17 | Reis Rodrigo Miguel | 2004 | POR Associacao Desportiva Bairro Dos Anjos /Bomcar | 00'25''87 | 528 |
| 18 | Jorge Duarte Miguel | 2001 | POR Clube Galitos De Aveiro | 00'26''02 | 518 |
| 19 | Amaral Francisco Rodriguez | 2002 | POR Clube Desportivo De Campinho | 00'26''10 | 514 |
| 20 | Domingues Ricardo Jorge | 2002 | POR Fundacao Beatriz Santos-Clube | 00'26''16 | 510 |
| 21 | Alves Joao Brandao | 2003 | POR Centro Juvenil Salesiano De Arouca | 00'26''24 | 506 |
| 22 | Oliveira David Miguel | 2001 | POR Clube Desportivo De Estarreja | 00'26''28 | 503 |
| 23 | Silva Luis Afonso | 2002 | POR Clube Desportivo De Estarreja | 00'26''29 | 503 |
| | Pereira Ricardo Marques | 2001 | POR Condeixa Aqua Clube | 00'26''29 | 503 |
| 25 | Ferreira Joao Miguel | 1997 | POR Sporting Clube De Aveiro | 00'26''34 | 500 |
| 26 | Bras Alexandre Miguel | 2003 | POR Casa Povo S. Pedro Alva | 00'26''41 | 496 |
| 27 | Santos Alberto Antonio | 2001 | POR Casa Povo S. Pedro Alva | 00'26''42 | 495 |
| 28 | Patricio Rodrigo Alexandre | 1998 | POR Associacao Academica De Coimbra | 00'26''43 | 495 |
| | Silva Joao Jose | 2003 | POR Associacao Desportiva Bairro Dos Anjos /Bomcar | 00'26''43 | 495 |
| 30 | Silva Miguel Vicente | 2002 | POR Desportivo Nautico Da Marinha Grande | 00'26''44 | 494 |
| 31 | Julio Gabriel Jose | 2001 | POR Associacao Academica De Coimbra | 00'26''49 | 491 |
| 32 | Arzileiro Bernardo Vinagre | 2001 | POR Clube Uniao 1919 | 00'26''55 | 488 |
| | Sousa Guilherme Mendes | 2003 | POR Desportivo Nautico Da Marinha Grande | 00'26''55 | 488 |
| 34 | Simoes Manuel Baptista | 2003 | POR Clube Uniao 1919 | 00'26''69 | 480 |
| 35 | Oviedo Miguel Freitas | 2002 | POR Associacao Academica De Coimbra | 00'26''80 | 474 |
| 36 | Gomes Rodrigo Guedes | 2002 | POR Clube Desportivo Feirense | 00'26''84 | 472 |
| 37 | Centeio Fabio Mondego | 1994 | POR Associacao Academica De Coimbra | 00'26''85 | 472 |
| 38 | Ferreira Joao Vitor | 1996 | POR Clube Desportivo Feirense | 00'26''87 | 471 |
| 39 | Maximo Joao Luis | 1998 | POR Academia Cult Rec Concelho Castro Daire | 00'26''89 | 470 |
| 40 | Marques Vicente Cruzeiro | 2004 | POR Sporting Clube De Aveiro | 00'26''94 | 467 |
| 41 | Machado Martim Miranda | 2003 | POR Clube Uniao 1919 | 00'27''00 | 464 |
| 42 | Vidal Joao Pedro | 2003 | POR Industrial Desportivo Vieirense | 00'27''04 | 462 |
| 43 | Santos Guilherme Clara | 2002 | POR Associacao Estamos Juntos | 00'27''07 | 460 |
| | Coelho Joao Reis | 2003 | POR Assoc Educacao Fisica E Desp De Tondela | 00'27''07 | 460 |
| 45 | Sousa Duarte Anastacio | 2002 | POR Clube Uniao 1919 | 00'27''09 | 459 |
| 46 | Santos Luis Filipe | 2001 | POR Academico Viseu Futebol Clube | 00'27''11 | 458 |
| 47 | Oliveira Gil Diogo | 2001 | POR Assoc Pais Amigos Criancas Gafanha Da Encarnacao | 00'27''23 | 452 |
| 48 | Cordeiro Claudio Rafael | 2002 | POR Individual - Anic | 00'27''27 | 450 |
| 49 | Campos Rafael Alves | 2004 | POR Casa Povo S. Pedro Alva | 00'27''44 | 442 |
| 50 | Figueiredo Gustavo Pinto | 2002 | POR Academia Cult Rec Concelho Castro Daire | 00'27''55 | 437 |
| 51 | Caetano Gino Santos | 1994 | POR Clube Galitos De Aveiro | 00'27''58 | 435 |
| 52 | Correia Goncalo Pereira | 2000 | POR Associacao Academica De Coimbra | 00'27''59 | 435 |
| 53 | Antunes Andre Marques | 1999 | POR Fundacao Beatriz Santos-Clube | 00'27''62 | 433 |
| 54 | Breda Diogo Luis | 2001 | POR Associacao Academica De Coimbra | 00'27''71 | 429 |
| 55 | Tome David Emanuel | 2003 | POR Natacao Bombeiros Mealhada / Credito Agricola | 00'27''82 | 424 |
| 56 | Almeida Marco Andre | 2002 | POR Natacao Bombeiros Mealhada / Credito Agricola | 00'27''91 | 420 |
| 57 | Marques Rui Joao | 2002 | POR Clube Nautico Academico/Urgicentro-Sanfil | 00'27''93 | 419 |
| 58 | Tavares Licinio Silva | 2001 | POR Clube Desportivo De Estarreja | 00'27''94 | 419 |
| 59 | Tavares Vasco Capela | 1999 | POR Sporting Clube De Espinho | 00'27''96 | 418 |
| 60 | Solodyuk Micael Kovalchuk | 2003 | POR Clube Natacao De Vagos | 00'27''99 | 416 |
| 61 | Vaz Miguel Marques | 2000 | POR Sporting Clube De Espinho | 00'28''05 | 414 |
| 62 | Martins David Almeida | 2001 | POR Associacao Estamos Juntos | 00'28''17 | 408 |
| 63 | Florido Pedro Miguel | 2004 | POR Fundacao Beatriz Santos-Clube | 00'28''19 | 408 |
| 64 | Figueira Gabriel Jose | 2001 | POR Associacao Academica De Coimbra | 00'28''24 | 405 |
| 65 | Rodrigues Filipe Almeida | 2001 | POR Academia Cult Rec Concelho Castro Daire | 00'28''26 | 405 |
| 66 | Ventura Bernardo Jorge | 2003 | POR Associacao Academica De Coimbra | 00'28''47 | 396 |
| 67 | Frois Manuel Maria | 2002 | POR Associacao Desportiva Bairro Dos Anjos /Bomcar | 00'28''79 | 383 |
| 68 | Ramos Goncalo Soares | 2002 | POR Ginasio Clube Figueirense | 00'28''98 | 375 |
| 69 | Rocha Joao Filipe | 2004 | POR Sporting Clube De Espinho | 00'29''04 | 373 |
| 70 | Anastacio Alexandre Quiterio | 2001 | POR Benedita Sport Club Natacao | 00'29''12 | 370 |
| 71 | Moreira Vitor Hugo | 2002 | POR Clube Desportivo Feirense | 00'29''20 | 367 |
| 72 | Duarte Pedro Filipe | 2001 | POR Associacao Desportiva Sanjoanense/Fepsa | 00'29''31 | 363 |
| 73 | Duarte Joao Diogo | 2004 | POR Centro Juvenil Salesiano De Arouca | 00'29''42 | 359 |
| 74 | Monteiro Rodrigo Manuel | 1998 | POR Sporting Clube De Espinho | 00'29''50 | 356 |
| 75 | Meneses Marco Ribeiro | 2001 | POR Academia Cult Rec Concelho Castro Daire | 00'30''39 | 325 |
