| 1 | Rodrigues Tiago Moura | 2003 | POR Colegio Luso-Internacional Do Porto | 00'52''25 | 636 |  |  | |
50m 25.21 (25.21) 100m 52.25 (27.04) [52.25] |
| 2 | Ferreira Bernardo Felgueiras | 2003 | POR Colegio Luso-Internacional Do Porto | 00'53''10 | 606 | | | |
50m 25.63 (25.63) 100m 53.10 (27.47) [53.10] |
| 3 | Carvalho Fernando Costa | 2003 | POR Foca-Clube Natacao De Felgueiras | 00'54''64 | 556 | | | |
50m 26.19 (26.19) 100m 54.64 (28.45) [54.64] |
| 4 | Neto Rodrigo Jorge | 2003 | POR Clube Aquatico Pacense | 00'55''56 | 529 | | | |
50m 26.85 (26.85) 100m 55.56 (28.71) [55.56] |
| 5 | Mendes Ricardo Ferreira | 2003 | POR Colegio Liceal De Santa Maria De Lamas | 00'56''05 | 515 | | | |
50m 27.36 (27.36) 100m 56.05 (28.69) [56.05] |
| 6 | Rocha Bernardo Sousa | 2003 | POR Clube Fluvial Portuense | 00'56''54 | 502 | | | |
50m 27.63 (27.63) 100m 56.54 (28.91) [56.54] |
| 7 | Araujo Joao Guilherme | 2003 | POR Clube De Natacao Da Maia | 00'56''95 | 491 | | | |
50m 27.80 (27.80) 100m 56.95 (29.15) [56.95] |
| 8 | Dias Ruben Fonseca | 2003 | POR Clube De Natacao De Valongo | 00'57''04 | 489 | | | |
50m 27.65 (27.65) 100m 57.04 (29.39) [57.04] |
| 9 | Carvalho Tiago Fonseca | 2003 | POR Clube Naval Povoense | 00'57''20 | 484 | | | |
50m 27.47 (27.47) 100m 57.20 (29.73) [57.20] |
| 10 | Castro Duarte Monteiro | 2003 | POR Futebol Clube Do Porto | 00'57''70 | 472 | | | |
50m 27.85 (27.85) 100m 57.70 (29.85) [57.70] |
| 11 | Costa Hugo Alexandre | 2003 | POR Clube De Natacao De Valongo | 00'57''72 | 471 | | | |
50m 28.15 (28.15) 100m 57.72 (29.57) [57.72] |
| 12 | Leal Dinis Barros | 2003 | POR Clube Aquatico Pacense | 00'57''93 | 466 | | | |
50m 27.73 (27.73) 100m 57.93 (30.20) [57.93] |
| 13 | Ferreira Joao Carlos | 2003 | POR Futebol Clube Do Porto | 00'58''59 | 451 | | | |
50m 28.37 (28.37) 100m 58.59 (30.22) [58.59] |
| 14 | Ribeiro Vitor Hugo | 2003 | POR Lousada Seculo XXI | 00'58''60 | 451 | | | |
50m 28.30 (28.30) 100m 58.60 (30.30) [58.60] |
| 15 | Santos Antonio Miguel | 2003 | POR Clube Fluvial Vilacondense | 00'59''04 | 441 | | | |
50m 28.66 (28.66) 100m 59.04 (30.38) [59.04] |
| 16 | Sa Joao Luis | 2003 | POR Clube Fluvial Portuense | 00'59''22 | 437 | | | |
50m 28.15 (28.15) 100m 59.22 (31.07) [59.22] |
| 17 | Araujo Jose Miguel | 2003 | POR Vitoria Sport Clube/Olicargo | 00'59''68 | 426 | | | |
50m 28.38 (28.38) 100m 59.68 (31.30) [59.68] |
| 18 | Pereira Diogo Pontes | 2003 | POR Associacao Desportiva De Fafe | 00'59''69 | 426 | | | |
50m 29.40 (29.40) 100m 59.69 (30.29) [59.69] |
| 19 | Vasconcelos Bernardo Nunes | 2003 | POR Foca-Clube Natacao De Felgueiras | 00'59''71 | 426 | | | |
50m 28.77 (28.77) 100m 59.71 (30.94) [59.71] |
| 20 | Silva Jason | 2003 | POR Grupo Desportivo De Natacao De Vila Nova De Famalicao | 00'59''77 | 425 | | | |
50m 29.22 (29.22) 100m 59.77 (30.55) [59.77] |
| 21 | Pereira Daniel Santos | 2003 | POR Clube De Natacao De Valongo | 00'59''78 | 424 | | | |
50m 29.13 (29.13) 100m 59.78 (30.65) [59.78] |
| 22 | Santos Guilherme Silva | 2003 | POR Associacao Desportiva De Penafiel | 00'59''89 | 422 | | | |
50m 28.92 (28.92) 100m 59.89 (30.97) [59.89] |
| 23 | Teixeira Pedro Rui | 2003 | POR Clube Aquatico Pacense | 00'59''91 | 422 | | | |
50m 28.80 (28.80) 100m 59.91 (31.11) [59.91] |
| 24 | Fernandes Joao Bernardo | 2003 | POR Clube Naval Povoense | 01'00''60 | 407 | | | |
50m 29.16 (29.16) 100m 1:00.60 (31.44) [1:00.60] |
| 25 | Bessa Flavio Rafael | 2003 | POR Lousada Seculo XXI | 01'01''04 | 399 | | | |
50m 28.99 (28.99) 100m 1:01.04 (32.05) [1:01.04] |
| 26 | Marantes Goncalo Maria | 2003 | POR Futebol Clube Do Porto | 01'01''19 | 396 | | | |
50m 29.75 (29.75) 100m 1:01.19 (31.44) [1:01.19] |
| 27 | Maia Rodrigo Costa | 2003 | POR Clube Fluvial Portuense | 01'01''48 | 390 | | | |
50m 29.97 (29.97) 100m 1:01.48 (31.51) [1:01.48] |
| 28 | Carneiro Andre Martins | 2003 | POR Clube Aquatico Pacense | 01'01''55 | 389 | | | |
50m 29.51 (29.51) 100m 1:01.55 (32.04) [1:01.55] |
| 29 | Costa Nuno Ferreira | 2003 | POR Colegio Liceal De Santa Maria De Lamas | 01'03''46 | 355 | | | |
50m 31.13 (31.13) 100m 1:03.46 (32.33) [1:03.46] |
| 30 | Silva Rui Pedro | 2003 | POR Clube Fluvial Portuense | 01'03''54 | 353 | | | |
50m 30.14 (30.14) 100m 1:03.54 (33.40) [1:03.54] |
| 31 | Pereira Diogo Alexandre | 2003 | POR Clube De Natacao De Valongo | 01'04''76 | 334 | | | |
50m 30.86 (30.86) 100m 1:04.76 (33.90) [1:04.76] |
