| 1 | Cegonho Tomas Mamede | 2008 | POR Clube Natacao De Beja | 01'28''64 | 182 |  |  | |
50m 39.38 (39.38) 100m 1:28.64 (49.26) [1:28.64] |
| 2 | Teixeira Alexandre Moco | 2008 | POR Tavira Natacao Clube | 01'33''81 | 154 | | | |
50m 44.74 (44.74) 100m 1:33.81 (49.07) [1:33.81] |
| 3 | Cabrita Martim Santos | 2008 | POR Louletano Desportos Clube | 01'36''84 | 140 | | | |
50m 45.17 (45.17) 100m 1:36.84 (51.67) [1:36.84] |
| 4 | Van Doorn Owen | 2010 | POR Louletano Desportos Clube | 01'36''87 | 140 | | | |
50m 46.66 (46.66) 100m 1:36.87 (50.21) [1:36.87] |
| 5 | Perdigao Santiago Ganso | 2008 | POR Lagoa Academico Clube | 01'37''31 | 138 | | | |
50m 44.46 (44.46) 100m 1:37.31 (52.85) [1:37.31] |
| 6 | Federov Andriy | 2008 | POR Futebol Clube Ferreiras | 01'38''31 | 133 | | | |
50m 45.83 (45.83) 100m 1:38.31 (52.48) [1:38.31] |
| 7 | Martsynyshyn Vitaliy | 2008 | POR Futebol Clube Ferreiras | 01'38''78 | 132 | | | |
50m 46.38 (46.38) 100m 1:38.78 (52.40) [1:38.78] |
| 8 | Zelengorov Georgi Stoyanova | 2008 | POR Clube Natacao De Lagos | 01'39''04 | 131 | | | |
50m 46.63 (46.63) 100m 1:39.04 (52.41) [1:39.04] |
| 9 | Nunes Noe Martins | 2008 | POR Clube De Natacao De Faro | 01'39''35 | 129 | | | |
50m 45.96 (45.96) 100m 1:39.35 (53.39) [1:39.35] |
| 10 | Murta Joao Sena | 2008 | POR Clube De Natacao De Faro | 01'40''12 | 126 | | | |
50m 46.88 (46.88) 100m 1:40.12 (53.24) [1:40.12] |
| 11 | Viegas Francisco Morgado | 2008 | POR Clube De Natacao De Faro | 01'40''23 | 126 | | | |
50m 49.92 (49.92) 100m 1:40.23 (50.31) [1:40.23] |
| 12 | Pinto Luis Pedro | 2009 | POR Clube Natacao De Beja | 01'41''03 | 123 | | | |
50m 48.12 (48.12) 100m 1:41.03 (52.91) [1:41.03] |
| 13 | Lopes Joao Gabriel Terceiro | 2008 | POR Lagoa Academico Clube | 01'42''63 | 117 | | | |
50m 49.40 (49.40) 100m 1:42.63 (53.23) [1:42.63] |
| 14 | Serra Isaac Manuel | 2009 | POR Clube Nautico Do Guadiana | 01'43''06 | 116 | | | |
50m 50.02 (50.02) 100m 1:43.06 (53.04) [1:43.06] |
| 15 | Costa Tiago Afonso | 2009 | POR Louletano Desportos Clube | 01'44''92 | 110 | | | |
50m 48.83 (48.83) 100m 1:44.92 (56.09) [1:44.92] |
| 16 | Romao Francisco Antonio | 2009 | POR Louletano Desportos Clube | 01'46''18 | 106 | | | |
50m 47.55 (47.55) 100m 1:46.18 (58.63) [1:46.18] |
| 17 | Miguel Tomas Santos | 2009 | POR Lagoa Academico Clube | 01'47''03 | 103 | | | |
50m 50.44 (50.44) 100m 1:47.03 (56.59) [1:47.03] |
| 18 | Bolotinha Max Faria | 2009 | POR Louletano Desportos Clube | 01'47''37 | 102 | | | |
50m 50.75 (50.75) 100m 1:47.37 (56.62) [1:47.37] |
| 19 | Sousa Tiago Goncalves | 2009 | POR Louletano Desportos Clube | 01'48''41 | 99 | | | |
50m 50.88 (50.88) 100m 1:48.41 (57.53) [1:48.41] |
| 20 | Matos Miguel De Palma | 2008 | POR Clube De Natacao De Faro | 01'48''53 | 99 | | | |
50m 54.44 (54.44) 100m 1:48.53 (54.09) [1:48.53] |
| 21 | Lopes Angel Gabriel | 2008 | POR Louletano Desportos Clube | 01'49''09 | 98 | | | |
50m 52.63 (52.63) 100m 1:49.09 (56.46) [1:49.09] |
| 22 | Cavaco Gabriel Martins | 2008 | POR Clube Nautico Do Guadiana | 01'49''47 | 97 | | | |
50m 49.80 (49.80) 100m 1:49.47 (59.67) [1:49.47] |
| 23 | Brito Luciano | 2008 | POR Louletano Desportos Clube | 01'49''71 | 96 | | | |
50m 53.08 (53.08) 100m 1:49.71 (56.63) [1:49.71] |
| 24 | Ferreira Guilherme Sameiro | 2008 | POR Futebol Clube Ferreiras | 01'52''06 | 90 | | | |
50m 53.51 (53.51) 100m 1:52.06 (58.55) [1:52.06] |
| 25 | Brinza Adrian | 2008 | POR Lagoa Academico Clube | 01'53''58 | 86 | | | |
50m 51.87 (51.87) 100m 1:53.58 (1:01.71) [1:53.58] |
| 26 | Timotin Catalin | 2009 | POR Louletano Desportos Clube | 01'56''92 | 79 | | | |
50m 57.63 (57.63) 100m 1:56.92 (59.29) [1:56.92] |
| 27 | Mateus Diogo Jose Martins | 2008 | POR Lagoa Academico Clube | 02'02''51 | 69 | | | |
50m 58.76 (58.76) 100m 2:02.51 (1:03.75) [2:02.51] |
| | Kunyk Nestor | 2008 | POR Lagoa Academico Clube | Squalificato | |
| | Vasian Gabriel | 2008 | POR Louletano Desportos Clube | Squalificato | |
