| 1 | Pereira Raquel Gomes | 2000 | POR Portugal | 01'15''26 | 618 |  |  | |
50m 35.67 (35.67) 100m 1:15.26 (39.59) [1:15.26] |
| 2 | De Pinho Rodrigues Ana | 1994 | POR Associacao Desportiva Sanjoanense/Fepsa | 01'16''08 | 598 | | | |
50m 35.35 (35.35) 100m 1:16.08 (40.73) [1:16.08] |
| 3 | Kaminskaya Victoria | 1995 | POR Portugal | 01'16''88 | 580 | | | |
50m 36.78 (36.78) 100m 1:16.88 (40.10) [1:16.88] |
| 4 | Zecchin Martina | 2002 | Team Lombardia Nuoto MGM SSD | 01'18''00 | 555 | | | |
50m 37.24 (37.24) 100m 1:18.00 (40.76) [1:18.00] |
| 5 | Silva Beatriz Santos | 2001 | POR Futebol Clube Do Porto | 01'18''04 | 554 | | | |
50m 35.56 (35.56) 100m 1:18.04 (42.48) [1:18.04] |
| 6 | Maia Joana Marques | 1991 | POR Ginasio Clube De Santo Tirso | 01'18''09 | 553 | | | |
50m 36.73 (36.73) 100m 1:18.09 (41.36) [1:18.09] |
| 7 | Teixeira Ines Oliveira | 2002 | POR Clube Desportivo De Estarreja | 01'19''82 | 518 | | | |
50m 37.43 (37.43) 100m 1:19.82 (42.39) [1:19.82] |
| 8 | Castro Maria Freitas | 2003 | POR Associacao Desportiva De Fafe | 01'20''28 | 509 | | | |
50m 37.56 (37.56) 100m 1:20.28 (42.72) [1:20.28] |
| 9 | Carpinteiro Carolina Silverio | 2002 | POR Clube De Natacao Do Tejo | 01'20''47 | 506 | | | |
50m 38.13 (38.13) 100m 1:20.47 (42.34) [1:20.47] |
| 10 | Goncalves Sofia Filipa | 2001 | POR Leixoes Sport Club | 01'20''68 | 502 | | | |
50m 38.16 (38.16) 100m 1:20.68 (42.52) [1:20.68] |
| 11 | Domingues Luana Pinto | 2003 | POR Associacao Desportiva Bairro Dos Anjos /Bomcar | 01'21''04 | 495 | | | |
50m 38.21 (38.21) 100m 1:21.04 (42.83) [1:21.04] |
| 12 | Pereira Carolina Rei | 2005 | POR Clube Natacao De Vagos | 01'21''45 | 488 | | | |
50m 38.31 (38.31) 100m 1:21.45 (43.14) [1:21.45] |
| 13 | Rego Ines Faria | 2005 | POR Grupo Desportivo De Natacao De Vila Nova De Famalicao | 01'21''64 | 484 | | | |
50m 37.79 (37.79) 100m 1:21.64 (43.85) [1:21.64] |
| 14 | Agostinho Catia Iordan | 2002 | POR Clube Natacao De Rio Maior | 01'22''00 | 478 | | | |
50m 38.50 (38.50) 100m 1:22.00 (43.50) [1:22.00] |
| 15 | Rodrigues Marta Silva | 2004 | POR Clube Naval Povoense | 01'22''54 | 469 | | | |
50m 38.19 (38.19) 100m 1:22.54 (44.35) [1:22.54] |
| 16 | Silva Ana Carolina | 2005 | POR Clube Naval Praia Da Vitoria | 01'22''83 | 464 | | | |
50m 38.14 (38.14) 100m 1:22.83 (44.69) [1:22.83] |
| 17 | Oliveira Claudia Sofia | 2002 | POR Associacao Desportiva Sanjoanense/Fepsa | 01'23''61 | 451 | | | |
50m 39.36 (39.36) 100m 1:23.61 (44.25) [1:23.61] |
| 18 | Ruiz Garrigo Marta | 2004 | ESP A.N. Gramenet | 01'23''65 | 450 | | | |
50m 38.69 (38.69) 100m 1:23.65 (44.96) [1:23.65] |
| 19 | Amorim Maria Leonor | 2003 | POR Futebol Clube Do Porto | 01'24''83 | 432 | | | |
50m 38.74 (38.74) 100m 1:24.83 (46.09) [1:24.83] |
| 20 | Vieira Valeria Goncalves | 2002 | POR Vitoria Sport Clube/Olicargo | 01'24''88 | 431 | | | |
50m 38.79 (38.79) 100m 1:24.88 (46.09) [1:24.88] |
| 21 | Batista Barbara Vivas | 2004 | POR Colegio Luso-Internacional Do Porto | 01'25''32 | 424 | | | |
50m 39.78 (39.78) 100m 1:25.32 (45.54) [1:25.32] |
| 22 | Ferreira Marta Oliveira | 2004 | POR Ginasio Clube De Santo Tirso | 01'25''61 | 420 | | | |
50m 40.16 (40.16) 100m 1:25.61 (45.45) [1:25.61] |
| 23 | Lopes Margarida Santos | 2004 | POR Clube Desportivo De Estarreja | 01'25''88 | 416 | | | |
50m 40.05 (40.05) 100m 1:25.88 (45.83) [1:25.88] |
| 24 | Monteiro Ines Maria | 2004 | POR Clube Naval Praia Da Vitoria | 01'25''90 | 416 | | | |
50m 40.22 (40.22) 100m 1:25.90 (45.68) [1:25.90] |
| 25 | Santos Catarina Bentes | 2005 | POR Clube Aquatico Pacense | 01'26''06 | 413 | | | |
50m 40.49 (40.49) 100m 1:26.06 (45.57) [1:26.06] |
| 26 | Santos Diana Sofia | 2002 | POR Clube Desportivo De Estarreja | 01'26''38 | 409 | | | |
50m 40.64 (40.64) 100m 1:26.38 (45.74) [1:26.38] |
| 27 | Martins Margarida Carvalhal | 2005 | POR Grupo Desportivo De Natacao De Vila Nova De Famalicao | 01'27''42 | 394 | | | |
50m 40.74 (40.74) 100m 1:27.42 (46.68) [1:27.42] |
| 28 | Barros Alexia Bastos | 2004 | POR Associacao Desportiva De Fafe | 01'27''64 | 391 | | | |
50m 40.58 (40.58) 100m 1:27.64 (47.06) [1:27.64] |
| 29 | Neves Maria Manuel | 2005 | POR Sporting Clube De Braga | 01'28''27 | 383 | | | |
50m 41.12 (41.12) 100m 1:28.27 (47.15) [1:28.27] |
| 30 | Frois Maria Francisca | 2006 | POR Associacao Desportiva Bairro Dos Anjos /Bomcar | 01'28''37 | 382 | | | |
50m 41.69 (41.69) 100m 1:28.37 (46.68) [1:28.37] |
| 31 | Silveira Sofia Pereira | 2005 | POR Clube Act Fisica Bomb. De Ponta Delgada | 01'31''37 | 345 | | | |
50m 42.68 (42.68) 100m 1:31.37 (48.69) [1:31.37] |
