| 1 | De Pinho Rodrigues Ana | 1994 | POR Associacao Desportiva Sanjoanense/Fepsa | 01'11''08 | 675 |  |  | |
50m 33.17 (33.17) 100m 1:11.08 (37.91) [1:11.08] |
| 2 | Kaminskaya Victoria | 1995 | POR Sport Lisboa E Benfica | 01'11''42 | 665 | | | |
50m 34.18 (34.18) 100m 1:11.42 (37.24) [1:11.42] |
| 3 | Pereira Raquel Gomes | 2000 | POR Sport Alges E Dafundo | 01'11''64 | 659 | | | |
50m 33.57 (33.57) 100m 1:11.64 (38.07) [1:11.64] |
| 4 | Veiga Ana Filipa | 2001 | POR Assoc Pais Amigos Criancas Gafanha Da Encarnacao | 01'12''18 | 644 | | | |
50m 34.55 (34.55) 100m 1:12.18 (37.63) [1:12.18] |
| 5 | Machado Luisa Maria | 2001 | POR Sociedade Filarmonica Uniao Artistica Piedense | 01'12''53 | 635 | | | |
50m 34.73 (34.73) 100m 1:12.53 (37.80) [1:12.53] |
| 6 | Ferreira Borges Claudia | 1999 | POR Sport Lisboa E Benfica | 01'13''41 | 612 | | | |
50m 34.98 (34.98) 100m 1:13.41 (38.43) [1:13.41] |
| 7 | Silva Beatriz Santos | 2001 | POR Futebol Clube Do Porto | 01'13''69 | 606 | | | |
50m 34.41 (34.41) 100m 1:13.69 (39.28) [1:13.69] |
| 8 | Rosa Maria Carolina | 1994 | POR Sporting Clube De Portugal | 01'14''33 | 590 | | | |
50m 34.67 (34.67) 100m 1:14.33 (39.66) [1:14.33] |
| 9 | Rodrigues Luana Correia | 2001 | POR Clube De Futebol Os Belenenses | 01'14''51 | 586 | | | |
50m 35.19 (35.19) 100m 1:14.51 (39.32) [1:14.51] |
| 10 | Bernardo Ines Silva | 2000 | POR Sport Lisboa E Benfica | 01'14''67 | 582 | | | |
50m 35.45 (35.45) 100m 1:14.67 (39.22) [1:14.67] |
| 11 | Leonardo Rute Isabel | 1998 | POR Clube Nautico De Abrantes | 01'15''00 | 574 | | | |
50m 35.40 (35.40) 100m 1:15.00 (39.60) [1:15.00] |
| 12 | Maia Joana Marques | 1991 | POR Ginasio Clube De Santo Tirso | 01'15''17 | 570 | | | |
50m 35.60 (35.60) 100m 1:15.17 (39.57) [1:15.17] |
| 13 | Mestre Catarina Martins | 2000 | POR Clube De Natacao De Lisboa | 01'15''23 | 569 | | | |
50m 35.63 (35.63) 100m 1:15.23 (39.60) [1:15.23] |
| 14 | Riesenberger Bruna Martins | 1997 | POR Clube De Instrucao E Recreio Do Laranjeiro | 01'16''55 | 540 | | | |
50m 35.62 (35.62) 100m 1:16.55 (40.93) [1:16.55] |
| 15 | Silva Maria Madalena | 1998 | POR Sporting Clube De Braga | 01'16''61 | 539 | | | |
50m 36.04 (36.04) 100m 1:16.61 (40.57) [1:16.61] |
| 16 | Matos Carolina Lourenco | 1998 | POR Clube Desportivo Cova Da Piedade | 01'16''74 | 536 | | | |
50m 36.10 (36.10) 100m 1:16.74 (40.64) [1:16.74] |
| 17 | Dionisio Sofia Machado | 1998 | POR Sporting Clube De Portugal | 01'17''92 | 512 | | | |
50m 35.30 (35.30) 100m 1:17.92 (42.62) [1:17.92] |
| 18 | Dias Beatriz Castanheira | 1999 | POR Associacao Academica De Coimbra | 01'19''47 | 483 | | | |
50m 37.56 (37.56) 100m 1:19.47 (41.91) [1:19.47] |
