| 1 | Costa Marco Antonio | 2002 | POR Clube De Natacao Da Guarda | 00'57''55 | 541 |
| 2 | Alves Rodrigo Miguel | 2002 | POR Aminata-Evora Clube De Natacao | 00'58''66 | 511 |
| 3 | Korol Andre | 2003 | POR Aminata-Evora Clube De Natacao | 00'59''66 | 486 |
| 4 | Andrade Mario Luis | 2003 | POR Clube De Natacao De Portalegre | 01'00''77 | 459 |
| | Dias Simao Pedro | 2002 | POR Clube De Natacao Da Guarda | 01'00''77 | 459 |
| 6 | Boto Pedro Alexandre | 2002 | POR Clube De Natacao Do Litoral Alentejano | 01'01''10 | 452 |
| 7 | Ribeiro Miguel Aleixo | 2003 | POR Aminata-Evora Clube De Natacao | 01'02''49 | 423 |
| 8 | Dias Francisco Teixeira | 2002 | POR Assoc Natacao Albicastrense Os Redentoristas | 01'02''70 | 418 |
| 9 | Caldeira Isaias Francisco | 2002 | POR Ccd Pess. Camara Munic. Da Serta | 01'03''11 | 410 |
| 10 | Faias Joao Miguel | 2002 | POR Aminata-Evora Clube De Natacao | 01'03''31 | 406 |
| 11 | Alves Rafael Raimundo | 2003 | POR Clube Natacao Do Fundao | 01'03''38 | 405 |
| 12 | Silva Pedro Fale | 2003 | POR Atletico Clube Montemor-O-Novo | 01'03''54 | 402 |
| 13 | Calcona Joao Filipe | 2002 | POR Aminata-Evora Clube De Natacao | 01'04''46 | 385 |
| 14 | Custodio Guilherme Miguel | 2002 | POR Clube De Natacao Do Litoral Alentejano | 01'04''59 | 383 |
| 15 | Mendes Martim Rosa | 2003 | POR Assoc Natacao Albicastrense Os Redentoristas | 01'05''42 | 368 |
| 16 | Nunes Alexis Simao | 2002 | POR Assoc Natacao Albicastrense Os Redentoristas | 01'05''80 | 362 |
| 17 | Coelho Bruno Teixeira | 2003 | POR Clube De Natacao Da Guarda | 01'06''25 | 355 |
| 18 | Grilo Miguel Santos | 2003 | POR Aminata-Evora Clube De Natacao | 01'06''95 | 343 |
| 19 | Campos Guilherme Moiteiro | 2002 | POR Assoc Natacao Albicastrense Os Redentoristas | 01'07''15 | 340 |
| 20 | Freire Pedro Alexandre | 2003 | POR Aminata-Evora Clube De Natacao | 01'07''18 | 340 |
| 21 | Dias Jose Miguel | 2003 | POR Centro Rep. Inst. Rec. Aljustrelense | 01'07''60 | 334 |
| 22 | Paiva Joao Pedro | 2002 | POR Aminata-Evora Clube De Natacao | 01'07''78 | 331 |
| 23 | Agostinho Iuri Aragonez | 2003 | POR Clube De Natacao De Portalegre | 01'07''80 | 331 |
| 24 | Frois Andre Filipe | 2002 | POR Clube Futebol De Estremoz | 01'09''69 | 304 |
| 25 | Neves Antonio Correia | 2003 | POR Nucleo Desportivo E Cultural De Odemira | 01'10''33 | 296 |
| 26 | Benjamim Miguel Alexandre | 2003 | POR Assoc Natacao Albicastrense Os Redentoristas | 01'13''30 | 262 |
