| 1 | Viggiani Giovanni Pio | 2006 | Aquarius Piscina Canosa | 01'00''90 | 401 |
| 2 | Quarto Francesco Pio | 2005 | Aquarius Piscina Canosa | 01'05''80 | 318 |
| 3 | Giordano Gabriele Onorino | 2005 | Mediterraneo Sport SSD - Taranto | 01'07''20 | 299 |
| 4 | Potuto Matteo | 2005 | Nuotatori Pugliesi ASD | 01'07''70 | 292 |
| 5 | Marzulli Gianluca | 2005 | Aquatika SSD - Martina Franca | 01'08''70 | 279 |
| 6 | Campa Gabriele | 2005 | Nuotatori Pugliesi ASD | 01'11''70 | 246 |
| 7 | Lisi Antonio | 2005 | Nuotatori Pugliesi ASD | 01'12''20 | 241 |
| 8 | Boccadamo Lorenzo Giuseppe | 2006 | Polisportiva Centrosport Brindisi | 01'12''50 | 238 |
| 9 | Franco Jonas | 2006 | Feel Good SSD - Cellino San Marco | 01'13''10 | 232 |
| 10 | Lorizzo Francesco | 2006 | Planet Andria SSD - Altamura | 01'14''40 | 220 |
| 11 | Lorizzo Antonio | 2005 | Planet Andria SSD - Altamura | 01'16''10 | 205 |
| 12 | Pezzolla Giovanni | 2006 | Icos Sporting Club | 01'17''10 | 198 |
| 13 | Paladini Giacomo | 2006 | Feel Good SSD - Cellino San Marco | 01'17''40 | 195 |
| 14 | De Masi Lorenzo | 2006 | Feel Good SSD - Cellino San Marco | 01'17''70 | 193 |
| 15 | D'Alessandro Angelo | 2006 | Payton Bari ASD | 01'18''00 | 191 |
| 16 | Ferreri Giuseppe | 2006 | Waterpolo Bari ASD | 01'18''10 | 190 |
| 17 | Papadia Ruben | 2006 | Feel Good SSD - Cellino San Marco | 01'19''90 | 177 |
| 18 | Zambetti Andrea | 2006 | Nuoto Giovinazzo SSD | 01'20''40 | 174 |
| 19 | Giulitto Biagio Giuseppe | 2006 | Sport Project SSD | 01'23''70 | 154 |
| 20 | Sacca' Matteo | 2006 | Mediterranea Nuoto SSD - Grottaglie | 01'25''50 | 145 |
| 21 | Monno Mattia | 2006 | Payton Bari ASD | 01'34''80 | 106 |
