| 1 | Santos Dario Almeida | 1993 | POR Leixoes Sport Club | 00'53''45 | 594 |
| 2 | Graca Bernardo Leitao | 1993 | POR Clube De Natacao Da Maia | 00'53''92 | 578 |
| 3 | Lourenco Tiago Campos | 2002 | POR Clube De Natacao De Valongo | 00'54''54 | 559 |
| 4 | Lima David Dias | 2000 | POR Clube Fluvial Vilacondense | 00'55''72 | 524 |
| 5 | Oliveira Manuel Filipe | 2002 | POR Colegio Liceal De Santa Maria De Lamas | 00'56''70 | 497 |
| 6 | Lopes Tomas Teixeira | 2002 | POR Foca-Clube Natacao De Felgueiras | 00'56''72 | 497 |
| 7 | Magalhaes Eduardo Miguel | 2002 | POR Vitoria Sport Clube/Olicargo | 00'57''17 | 485 |
| 8 | Moreira Paulo Ricardo | 1991 | POR Clube Propaganda Da Natacao | 00'58''86 | 445 |
| 9 | Neto Rodrigo Jorge | 2003 | POR Clube Aquatico Pacense | 00'58''88 | 444 |
| 10 | Fernandes Joao Bernardo | 2003 | POR Clube Naval Povoense | 00'59''32 | 434 |
| 11 | Rocha Diogo Joao | 2003 | POR Clube Fluvial Portuense | 00'59''77 | 425 |
| 12 | Pinheiro Domingos Tiago | 1998 | POR Ginasio Clube De Santo Tirso | 01'00''19 | 416 |
| 13 | Moura Diogo Goncalves | 2002 | POR Associacao Desportiva De Fafe | 01'01''05 | 398 |
| 14 | Baptista Coelho Alex | 2003 | POR Colegio Luso-Internacional Do Porto | 01'02''33 | 374 |
| 15 | Santos Guilherme Silva | 2003 | POR Associacao Desportiva De Penafiel | 01'03''90 | 347 |
| 16 | Teixeira Leonardo Filipe | 2000 | POR Assoc. Propriet. Da Urbanizacao Vila De Este | 01'04''45 | 339 |
