| 1 | Rodrigues Tiago Moura | 2003 | POR Colegio Luso-Internacional Do Porto | 04'46''68 | 554 |
| 2 | Araujo Joao Guilherme | 2003 | POR Clube De Natacao Da Maia | 04'52''45 | 522 |
| 3 | Faia Mateus Costa | 2003 | POR Grupo Desportivo De Natacao De Vila Nova De Famalicao | 04'53''85 | 514 |
| 4 | Mendes Ricardo Ferreira | 2003 | POR Colegio Liceal De Santa Maria De Lamas | 04'54''59 | 510 |
| 5 | Leal Dinis Barros | 2003 | POR Clube Aquatico Pacense | 04'55''03 | 508 |
| 6 | Ferreira Joao Carlos | 2003 | POR Futebol Clube Do Porto | 04'55''47 | 506 |
| 7 | Sousa Diogo Nunes | 2003 | POR Vitoria Sport Clube/Olicargo | 04'55''97 | 503 |
| 8 | Dias Ruben Fonseca | 2003 | POR Clube De Natacao De Valongo | 04'56''21 | 502 |
| 9 | Carvalho Fernando Costa | 2003 | POR Foca-Clube Natacao De Felgueiras | 04'57''57 | 495 |
| 10 | Marques Andre Costa | 2003 | POR Grupo Desportivo De Natacao De Vila Nova De Famalicao | 04'59''75 | 484 |
| 11 | Castro Duarte Monteiro | 2003 | POR Futebol Clube Do Porto | 04'59''89 | 484 |
| 12 | Costa Hugo Alexandre | 2003 | POR Clube De Natacao De Valongo | 05'03''86 | 465 |
| 13 | Neto Rodrigo Jorge | 2003 | POR Clube Aquatico Pacense | 05'05''40 | 458 |
| 14 | Santos Antonio Miguel | 2003 | POR Clube Fluvial Vilacondense | 05'05''46 | 458 |
| 15 | Folha Diogo Antonio | 2003 | POR Leixoes Sport Club | 05'07''80 | 447 |
| 16 | Carneiro Joao Torres | 2003 | POR Grupo Desportivo De Natacao De Vila Nova De Famalicao | 05'08''22 | 446 |
| 17 | Carvalho Tiago Fonseca | 2003 | POR Clube Naval Povoense | 05'12''98 | 426 |
| 18 | Pereira Diogo Guimaraes | 2003 | POR Vitoria Sport Clube/Olicargo | 05'15''40 | 416 |
| 19 | Araujo Jose Miguel | 2003 | POR Grupo Desportivo De Natacao De Vila Nova De Famalicao | 05'17''53 | 407 |
| 20 | Gomes Joao Campelo | 2003 | POR Grupo Desportivo De Natacao De Vila Nova De Famalicao | 05'19''40 | 400 |
| 21 | Vasconcelos Bernardo Nunes | 2003 | POR Foca-Clube Natacao De Felgueiras | 05'19''93 | 398 |
| 22 | Fernandes Goncalo Herculano | 2003 | POR Vitoria Sport Clube/Olicargo | 05'20''82 | 395 |
| 23 | Rocha Diogo Joao | 2003 | POR Clube Fluvial Portuense | 05'24''37 | 382 |
| 24 | Rocha Bernardo Sousa | 2003 | POR Clube Fluvial Portuense | 05'25''76 | 377 |
| 25 | Castro Helder Ribeiro | 2003 | POR Vitoria Sport Clube/Olicargo | 05'25''77 | 377 |
| 26 | Ribeiro Goncalo Fernandes | 2003 | POR Clube Fluvial Portuense | 05'25''94 | 377 |
| 27 | Silva Ruben Filipe | 2003 | POR Foca-Clube Natacao De Felgueiras | 05'28''88 | 367 |
| 28 | Fernandes Joao Bernardo | 2003 | POR Clube Naval Povoense | 05'30''36 | 362 |
| 29 | Sa Joao Luis | 2003 | POR Clube Fluvial Portuense | 05'30''39 | 362 |
| 30 | Vilaca Joao Pedro | 2003 | POR Colegio Luso-Internacional Do Porto | 05'32''46 | 355 |
| 31 | Teixeira Pedro Rui | 2003 | POR Clube Aquatico Pacense | 05'33''62 | 351 |
| 32 | Baptista Coelho Alex | 2003 | POR Colegio Luso-Internacional Do Porto | 05'33''68 | 351 |
| 33 | Pereira Diogo Pontes | 2003 | POR Associacao Desportiva De Fafe | 05'36''00 | 344 |
| 34 | Faria Joao Martins | 2003 | POR Ginasio Clube De Santo Tirso | 05'37''40 | 340 |
| 35 | Santos Guilherme Silva | 2003 | POR Associacao Desportiva De Penafiel | 05'50''85 | 302 |
| | Silva Rui Pedro | 2003 | POR Clube Fluvial Portuense | Squalificato | |
