| 1 | Graca Bernardo Leitao | 1993 | POR Clube De Natacao Da Maia | 00'25''15 | 574 |
| 2 | Paquete Goncalo Manuel | 1999 | POR Clube Fluvial Portuense | 00'25''36 | 560 |
| 3 | Santos Dario Almeida | 1993 | POR Leixoes Sport Club | 00'25''62 | 543 |
| 4 | Costa Francisco Vilhena | 2000 | POR Clube Fluvial Vilacondense | 00'25''93 | 524 |
| 5 | Oliveira Luis Carlos | 1997 | POR Clube De Natacao Da Maia | 00'25''96 | 522 |
| 6 | Ferreira Bernardo Felgueiras | 2003 | POR Colegio Luso-Internacional Do Porto | 00'26''31 | 501 |
| 7 | Oliveira Rui Goncalves | 1993 | POR Clube De Natacao Da Maia | 00'26''81 | 474 |
| 8 | Silva David Fenker | 2000 | POR Colegio Liceal De Santa Maria De Lamas | 00'27''09 | 459 |
| 9 | Santos Andre Miguel | 2000 | POR Clube Fluvial Vilacondense | 00'27''30 | 449 |
| 10 | Ferreira Goncalo Fernando | 1994 | POR Associacao Desportiva De Penafiel | 00'27''40 | 444 |
| 11 | Ribeiro Joao Pedro | 2002 | POR Clube Fluvial Vilacondense | 00'27''64 | 432 |
| 12 | Freitas Joao Pinto | 2001 | POR Associacao Desportiva De Fafe | 00'27''74 | 428 |
| 13 | Pacheco Rui Tiago | 2001 | POR Clube Fluvial Vilacondense | 00'27''79 | 425 |
| 14 | Rocha Diogo Joao | 2003 | POR Clube Fluvial Portuense | 00'28''06 | 413 |
| 15 | Santos Joao Manuel | 1999 | POR Clube Fluvial Vilacondense | 00'28''17 | 408 |
| 16 | Pereira Afonso Fernandes | 2000 | POR Clube De Natacao Da Maia | 00'28''40 | 399 |
| 17 | Santos Antonio Miguel | 2003 | POR Clube Fluvial Vilacondense | 00'28''58 | 391 |
| 18 | Cunha Joao Simons | 2002 | POR Clube Fluvial Portuense | 00'28''61 | 390 |
| | Sousa Miguel Filipe | 2000 | POR Clube Propaganda Da Natacao | 00'28''61 | 390 |
| 20 | Fernandes Goncalo Herculano | 2003 | POR Vitoria Sport Clube/Olicargo | 00'28''82 | 381 |
| 21 | Picao Jose Pedro | 2001 | POR Leixoes Sport Club | 00'28''85 | 380 |
| 22 | Bessa Flavio Rafael | 2003 | POR Lousada Seculo XXI | 00'28''87 | 379 |
| 23 | Gomes Tiago Filipe | 2002 | POR Assoc. Propriet. Da Urbanizacao Vila De Este | 00'28''88 | 379 |
| 24 | Teixeira Pedro Rui | 2003 | POR Clube Aquatico Pacense | 00'28''92 | 377 |
| 25 | Paiva Joao Carlos | 2002 | POR Leixoes Sport Club | 00'29''00 | 374 |
| 26 | Seixas Bruno Miguel | 2001 | POR Clube De Natacao Da Maia | 00'29''03 | 373 |
| 27 | Pereira Diogo Guimaraes | 2003 | POR Vitoria Sport Clube/Olicargo | 00'29''28 | 364 |
| 28 | Vasconcelos Bernardo Nunes | 2003 | POR Foca-Clube Natacao De Felgueiras | 00'29''31 | 363 |
| 29 | Santos Guilherme Silva | 2003 | POR Associacao Desportiva De Penafiel | 00'29''90 | 342 |
| 30 | Magalhaes Tiago Novais | 2001 | POR Clube Fluvial Portuense | 00'30''49 | 322 |
| 31 | Costa Nuno Ferreira | 2003 | POR Colegio Liceal De Santa Maria De Lamas | 00'31''21 | 300 |
| 32 | Guedes Joao Pedro | 1997 | POR Colegio Liceal De Santa Maria De Lamas | 00'31''42 | 294 |
| 33 | Cunha Daniel Francisco | 2003 | POR Foca-Clube Natacao De Felgueiras | 00'32''58 | 264 |
| 34 | Oliveira David Araujo | 2003 | POR Associacao Desportiva De Fafe | 00'34''66 | 219 |
| | Marques Joao Miguel | 2002 | POR Foca-Clube Natacao De Felgueiras | Squalificato | |
