| 1 | Martins Leandro Caleiro | 2002 | POR Sport Alges E Agueda | 01'05''35 | 419 |  |  | |
50m 31.93 (31.93) 100m 1:05.35 (33.42) [1:05.35] |
| 2 | Rodrigues Miguel Carvalho | 2002 | POR Clube Galitos De Aveiro | 01'05''84 | 410 | | | |
50m 32.17 (32.17) 100m 1:05.84 (33.67) [1:05.84] |
| 3 | Gomes Rodrigo Guedes | 2002 | POR Clube Desportivo Feirense | 01'05''86 | 409 | | | |
50m 32.22 (32.22) 100m 1:05.86 (33.64) [1:05.86] |
| 4 | Marques Gustavo Oliveira | 2003 | POR Sporting Clube De Espinho | 01'06''55 | 397 | | | |
50m 32.37 (32.37) 100m 1:06.55 (34.18) [1:06.55] |
| 5 | Pais Andre Costa | 2002 | POR Clube Desportivo Feirense | 01'07''27 | 384 | | | |
50m 32.38 (32.38) 100m 1:07.27 (34.89) [1:07.27] |
| 6 | Santos Rafael Pinto | 2003 | POR Clube Desportivo Feirense | 01'07''61 | 378 | | | |
50m 33.39 (33.39) 100m 1:07.61 (34.22) [1:07.61] |
| 7 | Bulhosa Silvio Miguel | 2003 | POR Associacao Estamos Juntos | 01'10''28 | 337 | | | |
50m 34.13 (34.13) 100m 1:10.28 (36.15) [1:10.28] |
| 8 | Oliveira Daniel Valente | 2003 | POR Sporting Clube De Aveiro | 01'12''72 | 304 | | | |
50m 35.43 (35.43) 100m 1:12.72 (37.29) [1:12.72] |
| 9 | Tavares Bernardo Lopes | 2002 | POR Clube Desportivo Feirense | 01'12''82 | 303 | | | |
50m 35.13 (35.13) 100m 1:12.82 (37.69) [1:12.82] |
| 10 | Moreira Vitor Hugo | 2002 | POR Clube Desportivo Feirense | 01'17''22 | 254 | | | |
50m 37.07 (37.07) 100m 1:17.22 (40.15) [1:17.22] |
| 11 | Gomes Bruno Ferreira | 2003 | POR Clube Desportivo Feirense | 01'18''08 | 245 | | | |
50m 37.39 (37.39) 100m 1:18.08 (40.69) [1:18.08] |
| 12 | Vaz Luis Vicente | 2003 | POR Sporting Clube De Espinho | 01'21''56 | 215 | | | |
50m 39.13 (39.13) 100m 1:21.56 (42.43) [1:21.56] |
| 13 | Correia Goncalo Da Silva | 2002 | POR Clube Desportivo Feirense | 01'21''72 | 214 | | | |
50m 39.47 (39.47) 100m 1:21.72 (42.25) [1:21.72] |
| 14 | Fountoura Joao Pedro | 2003 | POR Clube Desportivo De Campinho | 01'25''36 | 188 | | | |
50m 41.11 (41.11) 100m 1:25.36 (44.25) [1:25.36] |
| 15 | Ferreira Joao Santos | 2003 | POR Clube Desportivo Feirense | 01'34''44 | 138 | | | |
50m 43.92 (43.92) 100m 1:34.44 (50.52) [1:34.44] |
| 16 | Melo Helder Xavier | 2003 | POR Clube Desportivo Feirense | 01'39''43 | 119 | | | |
50m 47.60 (47.60) 100m 1:39.43 (51.83) [1:39.43] |
