| 1 | Andre Angelica Maria | 1994 | POR Clube Fluvial Portuense | 01'15''14 | 571 |  |  | |
50m 35.15 (35.15) 100m 1:15.14 (39.99) [1:15.14] |
| 2 | Martins Ana Joao | 2000 | POR Sport Clube De Mirandela | 01'17''65 | 517 | | | |
50m 36.06 (36.06) 100m 1:17.65 (41.59) [1:17.65] |
| 3 | Freitas Guedes Ana Margarida | 2001 | POR Ginasio Clube De Vila Real | 01'18''39 | 503 | | | |
50m 36.99 (36.99) 100m 1:18.39 (41.40) [1:18.39] |
| 4 | Costa Ana Rita | 2001 | POR Clube De Natacao De Valongo | 01'21''20 | 452 | | | |
50m 37.92 (37.92) 100m 1:21.20 (43.28) [1:21.20] |
| 5 | Magalhaes Ana Catarina | 2002 | POR Associacao Desportiva De Penafiel | 01'23''07 | 423 | | | |
50m 39.10 (39.10) 100m 1:23.07 (43.97) [1:23.07] |
| 6 | Vieira Constanca Seabra | 2003 | POR Flavitus Natacao Clube | 01'25''84 | 383 | | | |
50m 39.74 (39.74) 100m 1:25.84 (46.10) [1:25.84] |
| 7 | Batista Barbara Vivas | 2004 | POR Colegio Luso-Internacional Do Porto | 01'26''78 | 371 | | | |
50m 40.92 (40.92) 100m 1:26.78 (45.86) [1:26.78] |
| 8 | Campos Ines Paiva | 2003 | POR Colegio Liceal De Santa Maria De Lamas | 01'30''02 | 332 | | | |
50m 42.10 (42.10) 100m 1:30.02 (47.92) [1:30.02] |
| 9 | Costa Rita Salome | 2004 | POR Clube Aquatico Pacense | 01'33''16 | 299 | | | |
50m 43.42 (43.42) 100m 1:33.16 (49.74) [1:33.16] |
| 10 | Santos Cigarro Rafaela | 2002 | POR Clube Municipal Peso Da Regua | 01'39''09 | 249 | | | |
50m 45.84 (45.84) 100m 1:39.09 (53.25) [1:39.09] |
| 11 | Rodrigues Margarida Bernardo | 2004 | POR Santa Marta Penaguiao | 01'42''23 | 226 | | | |
50m 47.93 (47.93) 100m 1:42.23 (54.30) [1:42.23] |
| | Leite Sofia Margarida | 2003 | POR Foca-Clube Natacao De Felgueiras | Squalificato | |
