| 1 | Rocha Miguel Azevedo | 2006 | POR Associacao Desportiva De Penafiel | 01'21''15 | 207 |  |  | |
50m 35.90 (35.90) 100m 1:21.15 (45.25) [1:21.15] |
| 2 | Rocha Danilo Alves | 2006 | POR Viana Natacao Clube | 01'28''12 | 162 | | | |
50m 39.25 (39.25) 100m 1:28.12 (48.87) [1:28.12] |
| 3 | Lourenco Francisco Campos | 2006 | POR Clube De Natacao De Valongo | 01'28''55 | 160 | | | |
50m 40.05 (40.05) 100m 1:28.55 (48.50) [1:28.55] |
| 4 | Faria Eduardo Nuno | 2006 | POR Sporting Clube De Braga | 01'28''60 | 159 | | | |
50m 40.31 (40.31) 100m 1:28.60 (48.29) [1:28.60] |
| 5 | Mbarek Bruno Marcelo | 2006 | POR Clube Aquatico Pacense | 01'31''74 | 143 | | | |
50m 43.42 (43.42) 100m 1:31.74 (48.32) [1:31.74] |
| 6 | Pereira Pedro Santos | 2006 | POR Leixoes Sport Club | 01'36''45 | 123 | | | |
50m 45.75 (45.75) 100m 1:36.45 (50.70) [1:36.45] |
| 7 | Conceicao Rodrigo Santos | 2006 | POR Clube Naval Povoense | 01'39''92 | 111 | | | |
50m 42.87 (42.87) 100m 1:39.92 (57.05) [1:39.92] |
| 8 | Silva Alexis Alves | 2006 | POR Sporting Clube De Espinho | 01'39''96 | 111 | | | |
50m 45.27 (45.27) 100m 1:39.96 (54.69) [1:39.96] |
| 9 | Sampaio Francisco Manuel | 2006 | POR Foca-Clube Natacao De Felgueiras | 01'43''40 | 100 | | | |
50m 48.36 (48.36) 100m 1:43.40 (55.04) [1:43.40] |
| 10 | Calhandro Guilherme Oliveira | 2006 | POR Clube De Natacao Da Maia | 01'44''78 | 96 | | | |
50m 45.48 (45.48) 100m 1:44.78 (59.30) [1:44.78] |
| 11 | Igreja Pedro Roque | 2006 | POR Clube Fluvial Vilacondense | 01'52''86 | 77 | | | |
50m 50.10 (50.10) 100m 1:52.86 (1:02.76) [1:52.86] |
| 12 | Seca Rafael Lopes | 2007 | POR Associacao Desportiva De Fafe | 01'57''20 | 69 | | | |
50m 54.74 (54.74) 100m 1:57.20 (1:02.46) [1:57.20] |
| 13 | Braz Pedro Pereira | 2008 | POR Clube De Natacao Do Rosario | 02'09''90 | 50 | | | |
50m 57.96 (57.96) 100m 2:09.90 (1:11.94) [2:09.90] |
| | Brito Afonso Mascarenhas | 2007 | POR Ginasio Clube De Santo Tirso | Squalificato | |
| | Guimaraes Salvador Gaspar | 2007 | POR Clube Fluvial Portuense | Squalificato | |
