| 1 | Pina Guilherme Filipe | 1998 | POR Clube Nacional De Natacao | 00'24''47 | 559 |
| 2 | Mascarenhas Henrique Silva | 2001 | POR Clube Fluvial Portuense | 00'24''49 | 557 |
| 3 | Pereira Tomas Coelho | 2005 | POR Associacao Desportiva De Penafiel | 00'24''52 | 555 |
| 4 | Nunes Porfirio Braga | 2000 | POR Clube Naval Povoense | 00'24''55 | 553 |
| 5 | Lemos Gil Santos | 2006 | POR Sociedade Instrucao E Recreio Os Pimpoes/Cimai | 00'24''57 | 552 |
| 6 | Martins Joao Valente | 2007 | POR Futebol Clube Ferreiras | 00'24''59 | 551 |
| 7 | Pedrosa Carlos Lopes | 1994 | POR Clube Act Fisica Bomb. De Ponta Delgada | 00'24''61 | 549 |
| 8 | Ribeiro Vasco Almeida | 2005 | POR Sporting Clube De Sao Joao De Ver | 00'24''66 | 546 |
| 9 | Machado Sebastiao Amaro | 1993 | POR Academico Viseu Futebol Clube | 00'24''75 | 540 |
| 10 | Goncalves Da Graca Nuno Miguel | 1998 | POR Associacao Tubaroes De Gaia | 00'24''82 | 535 |
| 11 | Crespo Diogo Jesus | 1999 | POR Clube Desportivo Nacional | 00'24''83 | 535 |
| 12 | Kovalchuk Herman | 2006 | POR Ginasio Clube De Vila Real | 00'24''93 | 528 |
| 13 | Resende Alexandre Silva | 2007 | POR Clube Desportivo Feirense | 00'24''94 | 528 |
| 14 | Ferreira Pedro Guilherme | 2000 | POR Clube Nautico De Miranda Do Corvo | 00'24''99 | 525 |
| 15 | Figueiredo Luis Pedro | 2006 | POR Gesloures-Gestao Equip. Sociais, Em | 00'25''06 | 520 |
| 16 | Silva Pedro Manuel | 1997 | POR Ginasio Clube De Santo Tirso | 00'25''42 | 498 |
| 17 | Rita Francisco Xavier | 2007 | POR Industrial Desportivo Vieirense | 00'25''56 | 490 |
| 18 | Vilhena Lucas Silva | 2007 | POR Clube De Natacao Do Litoral Alentejano | 00'25''63 | 486 |
| | Bressan Henrique Perez | 2007 | POR Portinado-Assoc Natacao De Portimao | 00'25''63 | 486 |
| 20 | Barros Jose Pedro | 2008 | POR Associacao Desportiva De Fafe | 00'25''66 | 484 |
| 21 | Oliveira Joaquim Gabriel | 2007 | POR Sporting Clube De Aveiro | 00'25''84 | 474 |
| 22 | Baiao Gabriel Correia | 2008 | POR Lagoa Academico Clube | 00'26''00 | 466 |
| 23 | Pereira Miguel Gomes | 1995 | POR Clube Naval Setubalense | 00'26''04 | 464 |
| 24 | Venceslau Diogo Francisco | 2006 | POR Palmela Desporto Eem | 00'26''06 | 462 |
| 25 | Monteiro Jose Miguel | 2004 | POR Sociedade Filarmonica Gualdim Pais | 00'26''24 | 453 |
| 26 | Saramago Artur Rafael | 1997 | POR Buzios - Associacao De Nadadores Salvadores De Coruche | 00'26''30 | 450 |
| 27 | Pires Rui Filipe | 2006 | POR Clube Municipal Peso Da Regua | 00'26''55 | 437 |
| 28 | Soares Daniel Pacheco | 2004 | POR Clube Naval De Ponta Delgada | 00'26''58 | 436 |
| 29 | Oliveira Manuel Martins | 2008 | POR Sporting Clube De Espinho | 00'26''59 | 435 |
| 30 | Bulhosa Silvio Miguel | 2003 | POR Associacao Estamos Juntos | 00'26''80 | 425 |
| 31 | Alves Rodrigo Alexandre | 2006 | POR Clube Lazer Aventura E Competicao | 00'28''36 | 359 |
| | Costa Joao Peres | 2004 | POR Clube Naval Praia Da Vitoria | Squalificato | |
