| 1 | Rodrigues Ana Margarida | 1996 | POR Clube Galitos De Aveiro | 01'03''05 | 871,53 |  |  | |
50m 30.70 (30.70) 100m 1:03.05 (32.35) [1:03.05] |
| 2 | Matos Carolina Lourenco | 1998 | POR Benedita Sport Club Natacao | 01'03''42 | 866,45 | | | |
50m 30.53 (30.53) 100m 1:03.42 (32.89) [1:03.42] |
| 3 | Vinagre Marta Filipa | 1995 | POR Lisboa Poolsharks | 01'08''79 | 798,81 | | | |
50m 32.62 (32.62) 100m 1:08.79 (36.17) [1:08.79] |
| 4 | Santos Raquel Fernandes | 1998 | POR Clube Natacao Masters Almada | 01'10''35 | 781,09 | | | |
50m 32.84 (32.84) 100m 1:10.35 (37.51) [1:10.35] |
| 5 | Araujo Daniela Patricia | 1998 | POR Clube Natacao De Rio Maior | 01'13''69 | 745,69 | | | |
50m 34.50 (34.50) 100m 1:13.69 (39.19) [1:13.69] |
| 6 | Dias Joana Teixeira | 1997 | POR Clube Lazer Aventura E Competicao | 01'14''75 | 735,12 | | | |
50m 36.01 (36.01) 100m 1:14.75 (38.74) [1:14.75] |
| 7 | Canizalez Vanessa Alejandra | 1999 | POR Clube Natacao Do Fundao | 01'19''58 | 690,50 | | | |
50m 38.76 (38.76) 100m 1:19.58 (40.82) [1:19.58] |
| 8 | Paterno Ana Raquel | 1996 | POR Clube Natacao De Rio Maior | 01'30''99 | 603,91 | | | |
50m 44.29 (44.29) 100m 1:30.99 (46.70) [1:30.99] |
| 9 | Jose Patricia Alexandra | 1998 | POR Sociedade Filarmonica Gualdim Pais | 01'34''69 | 580,31 | | | |
50m 43.59 (43.59) 100m 1:34.69 (51.10) [1:34.69] |
