| 1 | Alves Catarina Andrade | 1978 | POR Clube Naval Do Funchal | 00'39''99 | 857,46 |
| 2 | Vilar Sonia Oliveira | 1979 | POR Clube De Natacao De Valongo | 00'41''30 | 830,27 |
| 3 | Silva Rita Rebelo | 1979 | POR Clube Fluvial Portuense | 00'41''38 | 828,66 |
| 4 | Barbara Carla Santa | 1975 | POR Futebol Clube Do Porto | 00'41''56 | 825,07 |
| 5 | Carvalho Elza Maria | 1976 | POR Clube Fluvial Portuense | 00'42''38 | 809,11 |
| 6 | Cavaleiro Joana Margarida | 1978 | POR Ginasio Clube Figueirense | 00'44''50 | 770,56 |
| 7 | Sa Inez Correa | 1979 | POR Lagoa Academico Clube | 00'44''88 | 764,04 |
| 8 | Fernandes Filipa Cristina | 1976 | POR Gesloures-Gestao Equip. Sociais, Em | 00'45''44 | 754,62 |
| 9 | Jorge Alexandra Maria | 1976 | POR Individual Annp | 00'46''06 | 744,46 |
| 10 | Pinto Susana Monteiro | 1976 | POR Centro Desp. Universitario Do Porto | 00'47''10 | 728,03 |
| 11 | Silva Rita Rijo | 1975 | POR Associacao Desportiva Rec Colegio Int Monte Maior | 00'48''89 | 701,37 |
| 12 | Nunes Marcia Silva | 1975 | POR Lagoa Academico Clube | 00'53''26 | 643,82 |
| 13 | Serra Maria Rosa | 1977 | POR Clube Naval Povoense | 00'54''42 | 630,10 |
| 14 | Mesquita Isabel Maria | 1975 | POR Clube De Natacao De Valongo | 00'55''58 | 616,95 |
| 15 | Massague Adriana Reguera | 1975 | POR Clube Fluvial Portuense | 00'55''68 | 615,84 |
| 16 | Correia Adriana Joao | 1978 | POR Clube Fluvial Vilacondense | 00'55''88 | 613,64 |
| 17 | Goncalves Isilda Maria | 1976 | POR Ccd Associacao De Nadadores Dos Estoris | 00'57''32 | 598,22 |
| 18 | Pereira Andrea Helena | 1977 | POR Sporting Clube Caminhense | 00'57''41 | 597,28 |
| 19 | Nunes Carla Sousinha | 1975 | POR Clube Nautico De Leiria | 00'58''05 | 590,70 |
| | Leal Patricia Sousa | 1977 | POR Clube De Natacao De Alcobaca | Squalificato | |
