| 1 | Martins Francisca Soares | 2003 | POR Foca-Clube Natacao De Felgueiras | 00'57''02 | 745 |  |  | |
50m 27.61 (27.61) 100m 57.02 (29.41) [57.02] |
| 2 | Fernandes Carolina Miranda | 2005 | POR Clube Galitos De Aveiro | 00'58''07 | 706 | | | |
50m 28.06 (28.06) 100m 58.07 (30.01) [58.07] |
| 3 | Conceicao Ema Jeronimo | 2003 | POR Associacao Ed. Fisica Desp. Torres Vedras | 00'58''27 | 698 | | | |
50m 28.05 (28.05) 100m 58.27 (30.22) [58.27] |
| 4 | Frischknecht Rita Barros | 1998 | POR Sporting Clube De Portugal | 00'58''64 | 685 | | | |
50m 28.23 (28.23) 100m 58.64 (30.41) [58.64] |
| 5 | Andre Leticia Maia | 2002 | POR Sport Lisboa E Benfica | 00'58''67 | 684 | | | |
50m 28.20 (28.20) 100m 58.67 (30.47) [58.67] |
| 6 | Fomina Anna | 2002 | POR Sporting Clube De Portugal | 00'58''91 | 676 | | | |
50m 28.53 (28.53) 100m 58.91 (30.38) [58.91] |
| 7 | Mercedes Mariana Marques | 2003 | POR Vikings Sports Club | 00'59''67 | 650 | | | |
50m 28.82 (28.82) 100m 59.67 (30.85) [59.67] |
| 8 | Viana Carolina Pereira | 2004 | POR Aquatico Clube De Silves | 00'59''71 | 649 | | | |
50m 28.95 (28.95) 100m 59.71 (30.76) [59.71] |
| 9 | Rodrigues Joana Francisca | 2004 | POR Condeixa Aqua Clube | 01'00''42 | 626 | | | |
50m 28.82 (28.82) 100m 1:00.42 (31.60) [1:00.42] |
| 10 | Coelho Maria Leonor | 2006 | POR Sport Lisboa E Benfica | 01'00''47 | 625 | | | |
50m 29.64 (29.64) 100m 1:00.47 (30.83) [1:00.47] |
| | Pradell Carrasco Mireia | 1995 | ESP CN Barcelona - Spagna | 01'00''47 | 625 | | | |
50m 28.96 (28.96) 100m 1:00.47 (31.51) [1:00.47] |
| 12 | Eira Maria Carolina | 2005 | POR Ginasio Clube De Vila Real | 01'00''61 | 620 | | | |
50m 29.21 (29.21) 100m 1:00.61 (31.40) [1:00.61] |
| 13 | Ramos Ruiz Carla | 2000 | ESP CN Barcelona - Spagna | 01'00''69 | 618 | | | |
50m 29.91 (29.91) 100m 1:00.69 (30.78) [1:00.69] |
| 14 | Faria Leonor Verissimo | 2006 | POR Nucleo Desporto Amador De Pombal | 01'00''72 | 617 | | | |
50m 30.00 (30.00) 100m 1:00.72 (30.72) [1:00.72] |
| 15 | Louro Ariana Espirito | 2005 | POR Sociedade Filarmonica Gualdim Pais | 01'00''75 | 616 | | | |
50m 29.38 (29.38) 100m 1:00.75 (31.37) [1:00.75] |
| 16 | Jesus Mariana Teixeira | 2006 | POR Clube Desportivo De Estarreja | 01'00''86 | 613 | | | |
50m 29.71 (29.71) 100m 1:00.86 (31.15) [1:00.86] |
| 17 | Teixeira Ines Correia | 2006 | POR Clube Natacao Da Amadora | 01'00''88 | 612 | | | |
50m 29.74 (29.74) 100m 1:00.88 (31.14) [1:00.88] |
| 18 | Gouveia Ana Luisa | 2006 | POR Colegio Efanor | 01'01''38 | 597 | | | |
50m 29.47 (29.47) 100m 1:01.38 (31.91) [1:01.38] |
| 19 | Fernandes Maria Teresa | 2005 | POR Sport Alges E Dafundo | 01'01''44 | 596 | | | |
50m 29.29 (29.29) 100m 1:01.44 (32.15) [1:01.44] |
| 20 | Brites Marta Lopes | 2006 | POR Clube Act Fisica Bomb. De Ponta Delgada | 01'01''60 | 591 | | | |
50m 29.23 (29.23) 100m 1:01.60 (32.37) [1:01.60] |
