| 1 | Caldas Tiago Guedes | 2011 | POR Sport Lisboa E Benfica | 01'39''93 | 169 |  |  | |
50m 46.28 (46.28) 100m 1:39.93 (53.65) [1:39.93] |
| 2 | Colin Rafael Ferreira | 2011 | POR Associacao Bombeiros Voluntarios Estoris | 01'43''16 | 154 | | | |
50m 48.35 (48.35) 100m 1:43.16 (54.81) [1:43.16] |
| 3 | Mata Matias Malheiro | 2011 | POR Sporting Clube De Portugal | 01'43''70 | 151 | | | |
50m 49.64 (49.64) 100m 1:43.70 (54.06) [1:43.70] |
| 4 | Major Batista Duarte | 2011 | POR Associacao Naval Amorense | 01'46''56 | 140 | | | |
50m 49.26 (49.26) 100m 1:46.56 (57.30) [1:46.56] |
| 5 | Fernandes Simao Manuel | 2011 | POR Associacao Desportiva Rec Colegio Int Monte Maior | 01'47''48 | 136 | | | |
50m 50.90 (50.90) 100m 1:47.48 (56.58) [1:47.48] |
| 6 | Couraceiro Fabio Martim | 2011 | POR Assoc Orientadora Natacao Desportiva Em Azeitao | 01'47''64 | 135 | | | |
50m 50.80 (50.80) 100m 1:47.64 (56.84) [1:47.64] |
| 7 | Veloso Santiago Costa | 2011 | POR Associacao Desportiva Rec Colegio Int Monte Maior | 01'49''15 | 130 | | | |
50m 51.00 (51.00) 100m 1:49.15 (58.15) [1:49.15] |
| 8 | Lima Duarte Ribeiro | 2011 | POR Gesloures-Gestao Equip. Sociais, Em | 01'49''43 | 129 | | | |
50m 51.81 (51.81) 100m 1:49.43 (57.62) [1:49.43] |
| 9 | Braga Andre Santos | 2011 | POR Clube Natacao Colegio Vasco Da Gama | 01'49''96 | 127 | | | |
50m 50.59 (50.59) 100m 1:49.96 (59.37) [1:49.96] |
| 10 | Ferreira David Miguel | 2011 | POR Gesloures-Gestao Equip. Sociais, Em | 01'50''28 | 126 | | | |
50m 52.70 (52.70) 100m 1:50.28 (57.58) [1:50.28] |
| 11 | Oliveira Vasco Ventura | 2011 | POR Clube Naval Setubalense | 01'50''33 | 126 | | | |
50m 52.30 (52.30) 100m 1:50.33 (58.03) [1:50.33] |
| 12 | Pereira Miguel Almeida | 2012 | POR Assoc Orientadora Natacao Desportiva Em Azeitao | 01'51''30 | 122 | | | |
50m 52.82 (52.82) 100m 1:51.30 (58.48) [1:51.30] |
| 13 | Aires Simao Verissimo | 2011 | POR Clube De Instrucao E Recreio Do Laranjeiro | 01'53''65 | 115 | | | |
50m 52.40 (52.40) 100m 1:53.65 (1:01.25) [1:53.65] |
| 14 | Brito Ricardo Canas | 2012 | POR Clube Naval Setubalense | 01'53''74 | 115 | | | |
50m 52.07 (52.07) 100m 1:53.74 (1:01.67) [1:53.74] |
| 15 | Barroca Rodrigo Mosquito | 2011 | POR Sporting Clube De Portugal | 01'53''93 | 114 | | | |
50m 52.93 (52.93) 100m 1:53.93 (1:01.00) [1:53.93] |
| 16 | Pereira Duarte Lopo | 2011 | POR Assoc Orientadora Natacao Desportiva Em Azeitao | 01'54''57 | 112 | | | |
50m 54.03 (54.03) 100m 1:54.57 (1:00.54) [1:54.57] |
| 17 | Costa Goncalo Nunes | 2012 | POR Gesloures-Gestao Equip. Sociais, Em | 01'56''08 | 108 | | | |
50m 54.78 (54.78) 100m 1:56.08 (1:01.30) [1:56.08] |
| 18 | Coelho Francisco Pimentel | 2011 | POR Sport Lisboa E Benfica | 01'56''31 | 107 | | | |
50m 56.04 (56.04) 100m 1:56.31 (1:00.27) [1:56.31] |
| 19 | Budu David | 2012 | POR Palmela Desporto Eem | 01'56''53 | 107 | | | |
50m 55.81 (55.81) 100m 1:56.53 (1:00.72) [1:56.53] |
| 20 | Vigario Goncalo Duarte | 2011 | POR Clube Naval Setubalense | 01'57''08 | 105 | | | |
50m 53.45 (53.45) 100m 1:57.08 (1:03.63) [1:57.08] |
| 21 | Pereira Antonio Melo | 2011 | POR Sport Lisboa E Benfica | 02'06''46 | 83 | | | |
50m 59.93 (59.93) 100m 2:06.46 (1:06.53) [2:06.46] |
| 22 | Ramalho Guilherme Fonseca | 2011 | POR Clube Nacional De Natacao | 02'18''08 | 64 | | | |
50m 1:04.51 (1:04.51) 100m 2:18.08 (1:13.57) [2:18.08] |
| | Mendes Guilherme Durand | 2011 | POR Sporting Clube De Portugal | Squalificato | |
| | Rosario Tiago Paiva | 2011 | POR Sporting Clube De Portugal | Squalificato | |
