| 1 | Pereira Tomas Coelho | 2005 | POR Associacao Desportiva De Penafiel | 01'03''20 | 463 |  |  | |
50m 31.37 (31.37) 100m 1:03.20 (31.83) [1:03.20] |
| 2 | Castro Guilherme Coutinho | 2005 | POR Grupo Desportivo De Natacao De Vila Nova De Famalicao | 01'06''80 | 392 | | | |
50m 32.41 (32.41) 100m 1:06.80 (34.39) [1:06.80] |
| 3 | Ribeiro Filipe Silva | 2005 | POR Leixoes Sport Club | 01'07''90 | 373 | | | |
50m 33.38 (33.38) 100m 1:07.90 (34.52) [1:07.90] |
| 4 | Silva Eduardo Costa | 2005 | POR Futebol Clube Do Porto | 01'09''44 | 349 | | | |
50m 34.25 (34.25) 100m 1:09.44 (35.19) [1:09.44] |
| 5 | Ribeiro Tomas Carvalhinho | 2005 | POR Clube De Natacao Da Maia | 01'10''04 | 340 | | | |
50m 34.96 (34.96) 100m 1:10.04 (35.08) [1:10.04] |
| 6 | Andrade Guilherme Nunes | 2005 | POR Clube Naval Povoense | 01'12''76 | 303 | | | |
50m 35.34 (35.34) 100m 1:12.76 (37.42) [1:12.76] |
| 7 | Guedes Alexandre Fontes | 2006 | POR Clube Desportivo Feirense | 01'13''13 | 298 | | | |
50m 35.47 (35.47) 100m 1:13.13 (37.66) [1:13.13] |
| 8 | Fonseca Goncalo Monteiro | 2005 | POR Clube Municipal Peso Da Regua | 01'14''39 | 284 | | | |
50m 37.03 (37.03) 100m 1:14.39 (37.36) [1:14.39] |
| 9 | Dias Pedro Anselmo | 2005 | POR Academico Viseu Futebol Clube | 01'14''68 | 280 | | | |
50m 37.30 (37.30) 100m 1:14.68 (37.38) [1:14.68] |
| 10 | Pinto Romulo Neves | 2006 | POR Colegio Liceal De Santa Maria De Lamas | 01'15''11 | 275 | | | |
50m 36.29 (36.29) 100m 1:15.11 (38.82) [1:15.11] |
| 11 | Martins Tiago Ventura | 2005 | POR Foca-Clube Natacao De Felgueiras | 01'15''25 | 274 | | | |
50m 36.82 (36.82) 100m 1:15.25 (38.43) [1:15.25] |
| 12 | Goncalves Manuel Alves | 2006 | POR Celorico Basto Clube Natacao | 01'18''10 | 245 | | | |
50m 37.73 (37.73) 100m 1:18.10 (40.37) [1:18.10] |
| 13 | Rodrigues Rodrigo Ferreira | 2005 | POR Academia Cult Rec Concelho Castro Daire | 01'18''65 | 240 | | | |
50m 38.69 (38.69) 100m 1:18.65 (39.96) [1:18.65] |
| 14 | Silva Tiago Lemos | 2005 | POR Clube Fluvial Portuense | 01'18''95 | 237 | | | |
50m 38.90 (38.90) 100m 1:18.95 (40.05) [1:18.95] |
| 15 | Pereira David Parreiras | 2006 | POR Associacao Desportiva Bairro Dos Anjos /Bomcar | 01'22''48 | 208 | | | |
50m 39.69 (39.69) 100m 1:22.48 (42.79) [1:22.48] |
| 16 | Silva Guilherme Ramos | 2006 | POR Clube Fluvial Vilacondense | 01'27''44 | 174 | | | |
50m 43.01 (43.01) 100m 1:27.44 (44.43) [1:27.44] |
| 17 | Oliveira Andre Dinis | 2005 | POR Vitoria Sport Clube/Olicargo | 01'29''81 | 161 | | | |
50m 43.48 (43.48) 100m 1:29.81 (46.33) [1:29.81] |
