| 1 | Amorim Alexandre Ferreira | 1999 | POR Universidade Porto | 00'29''52 | 625 |
| 2 | Veloso Tomas Miguel | 1996 | POR Associacao Academica De Coimbra | 00'29''77 | 610 |
| 3 | Simoes Rafael Gomes | 2000 | POR Ass Acad Univ Minho | 00'29''85 | 605 |
| 4 | Mendes Antonio Manuel | 1999 | POR Ae Instituto Superior Tecnico | 00'30''17 | 586 |
| 5 | Ramos Filipe Carmo | 1997 | POR Ae Instituto Superior Engenharia Porto | 00'30''22 | 583 |
| 6 | Soares Miguel Carlos | 1992 | POR Ae Instituto Superior Engenharia Porto | 00'30''30 | 578 |
| 7 | Machado Joao | 1999 | POR Universidade Nova Lisboa | 00'30''58 | 562 |
| 8 | Vos Mirka Artem | 2000 | POR Ass Acad Univ Aveiro | 00'30''70 | 556 |
| 9 | Capitao Simao Miguel | 1997 | POR Ass Acad Univ Beira Interior | 00'31''06 | 537 |
| 10 | Lopes Joao Francisco | 1998 | POR Instituto Politecnico De Viana Do Castelo | 00'31''16 | 532 |
| 11 | Lopes Luis Miguel | 1995 | POR Ass Acad Univ Beira Interior | 00'31''41 | 519 |
| 12 | Soares Luis Filipe | 1998 | POR Universidade Porto | 00'32''05 | 488 |
| 13 | Bessa Pedro Maria | 1995 | POR Associacao Academica De Coimbra | 00'32''58 | 465 |
| 14 | Teves Joao Pedro | 1999 | POR Instituto Politecnico Porto | 00'32''74 | 458 |
| 15 | Lemos Jose Pedro | 1999 | POR Instituto Politecnico Porto | 00'32''80 | 456 |
| 16 | Monteiro Ricardo Manuel | 1998 | POR Universidade Porto | 00'32''88 | 452 |
| 17 | Lopes Joao Paulo | 1998 | POR Ass Acad Univ Beira Interior | 00'33''07 | 445 |
| 18 | Mesquita Ricardo | 1996 | POR Instituto Politecnico Porto | 00'33''51 | 427 |
| 19 | Correia Ricardo Alexandre | 1997 | POR Ass Acad Univ Aveiro | 00'35''59 | 357 |
| 20 | Carvalho Joao Francisco | 1997 | POR Universidade Porto | 00'35''69 | 354 |
| 21 | Domingues Tomas Mota | 1999 | POR Universidade Porto | 00'35''74 | 352 |
| 22 | Morais Ricardo Filipe | 2000 | POR Ae Instituto Superior Engenharia Porto | 00'36''02 | 344 |
| 23 | Silva Francisco Brito | 1995 | POR Ass Acad Univ Minho | 00'37''65 | 301 |
| 24 | Teixeira Pedro | 1996 | POR Ass Acad Univ Minho | 00'41''09 | 232 |
| 25 | Curralo Pedro | 1998 | POR Ae Instituto Superior Engenharia Porto | 00'51''30 | 119 |
| | Santos Andre Goncalo | 1997 | POR Universidade Porto | Squalificato | |
| | Bastos Ruben | 1999 | POR Ae Instituto Superior Engenharia Porto | Squalificato | |
