| 1 | Costa Marco Antonio | 2002 | POR Clube De Natacao Da Guarda | 01'04''15 | 468 |
| 2 | Alves Rodrigo Miguel | 2002 | POR Aminata-Evora Clube De Natacao | 01'04''45 | 461 |
| 3 | Andrade Mario Luis | 2003 | POR Clube De Natacao De Portalegre | 01'07''76 | 397 |
| 4 | Boto Pedro Alexandre | 2002 | POR Clube De Natacao Do Litoral Alentejano | 01'08''39 | 386 |
| 5 | Nunes Alexis Simao | 2002 | POR Assoc Natacao Albicastrense Os Redentoristas | 01'08''93 | 377 |
| 6 | Custodio Guilherme Miguel | 2002 | POR Clube De Natacao Do Litoral Alentejano | 01'09''99 | 360 |
| 7 | Faias Joao Miguel | 2002 | POR Aminata-Evora Clube De Natacao | 01'10''77 | 348 |
| 8 | Silva Pedro Fale | 2003 | POR Atletico Clube Montemor-O-Novo | 01'11''56 | 337 |
| 9 | Alves Rafael Raimundo | 2003 | POR Clube Natacao Do Fundao | 01'15''00 | 293 |
| 10 | Frois Andre Filipe | 2002 | POR Clube Futebol De Estremoz | 01'15''65 | 285 |
| 11 | Freire Pedro Alexandre | 2003 | POR Aminata-Evora Clube De Natacao | 01'16''75 | 273 |
| 12 | Massas Pedro Miguel | 2002 | POR Clube Futebol De Estremoz | 01'16''93 | 271 |
