| 1 | Amaral Francisco Rodriguez | 2002 | POR Clube Desportivo De Campinho | 02'14''20 | 573 |
| | Goncalves Francisco Xavier | 1997 | POR Clube Nautico Academico/Urgicentro-Sanfil | 02'14''20 | 573 |
| 3 | Figueira Gabriel Jose | 2001 | POR Associacao Academica De Coimbra | 02'19''97 | 505 |
| 4 | Machado Tiago Andrade | 2002 | POR Sporting Clube De Aveiro | 02'20''24 | 502 |
| 5 | Matos Diogo Ribas | 2002 | POR Sport Alges E Agueda | 02'21''54 | 488 |
| 6 | Coelho Rodrigo Manuel | 2001 | POR Clube Desportivo Feirense | 02'22''25 | 481 |
| 7 | Ventura Jose Miguel | 1997 | POR Fundacao Beatriz Santos-Clube | 02'22''78 | 476 |
| 8 | Silva Luis Afonso | 2002 | POR Clube Desportivo De Estarreja | 02'23''61 | 468 |
| 9 | Santos Guilherme Clara | 2002 | POR Associacao Estamos Juntos | 02'24''19 | 462 |
| 10 | Domingues Ricardo Jorge | 2002 | POR Fundacao Beatriz Santos-Clube | 02'26''36 | 442 |
| 11 | Acioli Victor Hugo | 2002 | POR Clube Desportivo Feirense | 02'28''39 | 424 |
| 12 | Ferreira Tomas Soares | 2003 | POR Clube Desportivo De Estarreja | 02'28''46 | 423 |
| 13 | Oviedo Miguel Freitas | 2002 | POR Associacao Academica De Coimbra | 02'29''40 | 415 |
| 14 | Azevedo Nuno Miguel | 1999 | POR Clube Desportivo De Estarreja | 02'32''72 | 389 |
| 15 | Lourenco Goncalo Pires | 2003 | POR Fundacao Beatriz Santos-Clube | 02'32''84 | 388 |
| 16 | Carvalho Ricardo Martins | 2003 | POR Fundacao Beatriz Santos-Clube | 02'35''40 | 369 |
| 17 | Marques Rui Joao | 2002 | POR Clube Nautico Academico/Urgicentro-Sanfil | 02'38''04 | 351 |
| 18 | Sa Rafael Domingues | 2003 | POR Clube Natacao De Vagos | 02'39''93 | 338 |
| 19 | Machado Martim Miranda | 2003 | POR Clube Uniao 1919 | 02'41''14 | 331 |
| 20 | Santos Rafael Pinto | 2003 | POR Clube Desportivo Feirense | 02'45''92 | 303 |
| 21 | Figueiredo Gustavo Pinto | 2002 | POR Academia Cult Rec Concelho Castro Daire | 02'47''67 | 294 |
| 22 | Pereira Igor Branco | 2003 | POR Academia Cult Rec Concelho Castro Daire | 02'49''37 | 285 |
| 23 | Coelho Joao Salvador | 2003 | POR Academia Cult Rec Concelho Castro Daire | 02'55''37 | 257 |
