| 1 | Ferreira Joao Miguel | 1997 | POR Sporting Clube De Aveiro | 00'54''52 | 560 |  |  | |
50m 25.45 (25.45) 100m 54.52 (29.07) [54.52] |
| 2 | Moura Andre Magalhaes | 1998 | POR Academico Viseu Futebol Clube | 00'54''99 | 545 | | | |
50m 26.16 (26.16) 100m 54.99 (28.83) [54.99] |
| | Silva Job Santos | 1996 | POR Clube Desportivo Feirense | 00'54''99 | 545 | | | |
50m 26.52 (26.52) 100m 54.99 (28.47) [54.99] |
| 4 | Arrojado Ferreira Rafael Jose | 1994 | POR Clube Desportivo De Estarreja | 00'56''87 | 493 | | | |
50m 26.62 (26.62) 100m 56.87 (30.25) [56.87] |
| 5 | Correia Andre Filipe | 1997 | POR Clube Desportivo Feirense | 00'57''15 | 486 | | | |
50m 28.00 (28.00) 100m 57.15 (29.15) [57.15] |
| 6 | Oliveira Lino Ricardo | 1999 | POR Associacao Desportiva Sanjoanense/Fepsa | 00'58''62 | 450 | | | |
50m 28.00 (28.00) 100m 58.62 (30.62) [58.62] |
| 7 | Tavares Vasco Capela | 1999 | POR Sporting Clube De Espinho | 00'59''17 | 438 | | | |
50m 28.08 (28.08) 100m 59.17 (31.09) [59.17] |
| 8 | Almeida Ruben Manuel | 1995 | POR Clube Desportivo Feirense | 00'59''63 | 428 | | | |
50m 28.94 (28.94) 100m 59.63 (30.69) [59.63] |
| 9 | Oliveira Igor Emanuel | 1999 | POR Sporting Clube De Espinho | 01'00''62 | 407 | | | |
50m 28.86 (28.86) 100m 1:00.62 (31.76) [1:00.62] |
| 10 | Silva Hugo Gomes | 1994 | POR Clube Desportivo Feirense | 01'03''02 | 362 | | | |
50m 29.24 (29.24) 100m 1:03.02 (33.78) [1:03.02] |
| 11 | Gomes Nuno Filipe | 1997 | POR Clube Desportivo Feirense | 01'05''18 | 327 | | | |
50m 31.63 (31.63) 100m 1:05.18 (33.55) [1:05.18] |
| 12 | Poinho Joao Diogo | 1997 | POR Sporting Clube De Espinho | 01'05''74 | 319 | | | |
50m 30.40 (30.40) 100m 1:05.74 (35.34) [1:05.74] |
