| 1 | Fernandes Rui Afonso | 2003 | POR Clube Desportivo Nacional | 02'20''87 | 501 |  |  | |
100m 1:08.65 (1:08.65) [1:08.65] 200m 2:20.87 [1:12.22] |
| 2 | Silva Joao Jesus | 2002 | POR Juventude Atlantico Clube | 02'21''38 | 496 | | | |
100m 1:09.00 (1:09.00) [1:09.00] 200m 2:21.38 [1:12.38] |
| 3 | Castro Martim Pereira | 2002 | POR Clube Escola O Liceu | 02'32''67 | 393 | | | |
100m 1:14.88 (1:14.88) [1:14.88] 200m 2:32.67 [1:17.79] |
| 4 | Camacho Afonso Caires | 2004 | POR Clube Naval Do Funchal | 02'33''10 | 390 | | | |
100m 1:14.44 (1:14.44) [1:14.44] 200m 2:33.10 [1:18.66] |
| 5 | Alves Paulo Rodrigues | 2004 | POR Clube Desportivo Nacional | 02'37''73 | 357 | | | |
100m 1:17.03 (1:17.03) [1:17.03] 200m 2:37.73 [1:20.70] |
| 6 | Boulhosa Tiago Henrique | 2003 | POR Clube Naval Do Funchal | 02'38''99 | 348 | | | |
100m 1:18.17 (1:18.17) [1:18.17] 200m 2:38.99 [1:20.82] |
| 7 | Oliveira Diogo Alexandre | 2005 | POR Clube Naval Do Funchal | 02'44''00 | 317 | | | |
100m 1:20.67 (1:20.67) [1:20.67] 200m 2:44.00 [1:23.33] |
| 8 | Teles Artur Corte | 2004 | POR Clube Desportivo Sao Roque | 02'44''94 | 312 | | | |
100m 1:20.88 (1:20.88) [1:20.88] 200m 2:44.94 [1:24.06] |
| 9 | Dias Andre Vicente | 2005 | POR Clube Desportivo Nacional | 02'45''44 | 309 | | | |
100m 1:20.61 (1:20.61) [1:20.61] 200m 2:45.44 [1:24.83] |
| 10 | Jau Valter Henriques | 2001 | POR Clube Desportivo Nacional | 02'47''32 | 299 | | | |
100m 1:22.19 (1:22.19) [1:22.19] 200m 2:47.32 [1:25.13] |
| 11 | Rodrigues Rodrigo Reis | 2004 | POR Clube Desportivo Sao Roque | 02'48''37 | 293 | | | |
100m 1:23.33 (1:23.33) [1:23.33] 200m 2:48.37 [1:25.04] |
| 12 | Gouveia Luis Galvao | 2005 | POR Clube Desportivo Nacional | 02'49''56 | 287 | | | |
100m 1:23.95 (1:23.95) [1:23.95] 200m 2:49.56 [1:25.61] |
| 13 | Rodrigues Joao Afonso | 2005 | POR Clube Desportivo Sao Roque | 02'52''05 | 275 | | | |
100m 1:24.65 (1:24.65) [1:24.65] 200m 2:52.05 [1:27.40] |
| 14 | Santos Nuno Goncalo | 2005 | POR Clube Desportivo Sao Roque | 02'56''57 | 254 | | | |
100m 1:27.52 (1:27.52) [1:27.52] 200m 2:56.57 [1:29.05] |
| 15 | Pereira Jordao Abreu | 2004 | POR Juventude Atlantico Clube | 03'00''08 | 240 | | | |
100m 1:31.28 (1:31.28) [1:31.28] 200m 3:00.08 [1:28.80] |
| 16 | Vieira Emanuel Eloi | 2003 | POR Clube Desportivo Sao Roque | 03'05''52 | 219 | | | |
100m 1:30.21 (1:30.21) [1:30.21] 200m 3:05.52 [1:35.31] |
| 17 | Freitas Diogo Jesus | 2005 | POR Clube Desportivo Nacional | 03'13''07 | 194 | | | |
100m 1:36.40 (1:36.40) [1:36.40] 200m 3:13.07 [1:36.67] |
| 18 | Goncalves Vitor Afonso | 2004 | POR Juventude Atlantico Clube | 03'15''89 | 186 | | | |
100m 1:37.38 (1:37.38) [1:37.38] 200m 3:15.89 [1:38.51] |
| 19 | Ferreira Joao Miguel | 2005 | POR Clube Desportivo Sao Roque | 03'29''55 | 152 | | | |
100m 1:43.22 (1:43.22) [1:43.22] 200m 3:29.55 [1:46.33] |
| 20 | Gouveia Martim Caires | 2005 | POR Clube Escola O Liceu | 03'34''61 | 141 | | | |
100m 1:48.43 (1:48.43) [1:48.43] 200m 3:34.61 [1:46.18] |
| | Figueira Francisco Sousa | 2005 | POR Clube Desportivo Nacional | Squalificato | |
| | Gouveia Francisco Carvalho | 2003 | POR Associacao Desportiva De Machico | Squalificato | |
