| 1 | Henriques Joana Victorino | 2001 | POR Condeixa Aqua Clube | 01'06''88 | 608 |  |  | |
50m 31.31 (31.31) 100m 1:06.88 (35.57) [1:06.88] |
| 2 | Rodrigues Rebelo Camila | 2003 | POR Associacao Louzan Natacao | 01'08''74 | 560 | | | |
50m 31.76 (31.76) 100m 1:08.74 (36.98) [1:08.74] |
| 3 | Rebelo Maria Carlota | 2003 | POR Clube Uniao 1919 | 01'09''12 | 551 | | | |
50m 32.34 (32.34) 100m 1:09.12 (36.78) [1:09.12] |
| 4 | Veloso Teresa Miguel | 2000 | POR Clube Nautico Academico/Urgicentro-Sanfil | 01'09''22 | 548 | | | |
50m 31.87 (31.87) 100m 1:09.22 (37.35) [1:09.22] |
| 5 | Santos Tatiana Filipa | 1995 | POR Associacao Academica De Coimbra | 01'09''66 | 538 | | | |
50m 32.07 (32.07) 100m 1:09.66 (37.59) [1:09.66] |
| 6 | Neves Ana Carolina | 2000 | POR Associacao Academica De Coimbra | 01'10''32 | 523 | | | |
50m 31.34 (31.34) 100m 1:10.32 (38.98) [1:10.32] |
| 7 | Reis Ana Miguel | 2000 | POR Clube Nautico Academico/Urgicentro-Sanfil | 01'11''15 | 505 | | | |
50m 31.69 (31.69) 100m 1:11.15 (39.46) [1:11.15] |
| 8 | Monteiro Ana Carolina | 2004 | POR Clube Uniao 1919 | 01'12''01 | 487 | | | |
50m 34.32 (34.32) 100m 1:12.01 (37.69) [1:12.01] |
| 9 | Tomas Beatriz Monteiro | 2003 | POR Fundacao Beatriz Santos-Clube | 01'14''69 | 436 | | | |
50m 35.14 (35.14) 100m 1:14.69 (39.55) [1:14.69] |
| 10 | Silva Camila Alexandra | 2003 | POR Associacao Columbofila Cantanhedense | 01'15''10 | 429 | | | |
50m 36.75 (36.75) 100m 1:15.10 (38.35) [1:15.10] |
| 11 | Mendes Daniela Portela | 2004 | POR Condeixa Aqua Clube | 01'15''19 | 428 | | | |
50m 35.55 (35.55) 100m 1:15.19 (39.64) [1:15.19] |
| 12 | Carvalho Bruna Cruz | 2003 | POR Casa Povo S. Pedro Alva | 01'15''57 | 421 | | | |
50m 36.07 (36.07) 100m 1:15.57 (39.50) [1:15.57] |
| 13 | Dias Carolina Carreira | 2004 | POR Associacao Columbofila Cantanhedense | 01'16''07 | 413 | | | |
50m 35.91 (35.91) 100m 1:16.07 (40.16) [1:16.07] |
| 14 | Fernandes Margarete Leandro | 2000 | POR Associacao Louzan Natacao | 01'20''19 | 352 | | | |
50m 36.79 (36.79) 100m 1:20.19 (43.40) [1:20.19] |
| 15 | Jordao Milena Ferreira | 2003 | POR Junta Freguesia Do Paiao | 01'20''24 | 352 | | | |
50m 36.91 (36.91) 100m 1:20.24 (43.33) [1:20.24] |
| 16 | Nunes Ana Teresa | 1988 | POR Centro Apoio Soc Pais Amigos Da Escola | 01'23''16 | 316 | | | |
50m 37.63 (37.63) 100m 1:23.16 (45.53) [1:23.16] |
| 17 | Ferreira Patricia Caldeira | 2002 | POR Junta Freguesia Do Paiao | 01'24''00 | 307 | | | |
50m 38.44 (38.44) 100m 1:24.00 (45.56) [1:24.00] |
| | Marques Camila Ferreira | 2003 | POR Fundacao Beatriz Santos-Clube | Squalificato | |
