| 1 | Lustres Manuel Davila | 1996 | ESP Centro Gallego Tecnificacion Deportiva | 04'08''05 | 698 |
| 2 | Liess Thomas | 1995 | SUI Turrita Nuoto | 04'11''55 | 669 |
| 3 | Andrade Budino Gaspar | 1998 | ESP Centro Gallego Tecnificacion Deportiva | 04'11''74 | 668 |
| 4 | Da Graca Antunes Lopes Jose Paulo | 2000 | POR Sporting Clube De Braga | 04'13''43 | 654 |
| 5 | Morim Ruben Jose | 1997 | POR Clube Fluvial Vilacondense | 04'17''07 | 627 |
| 6 | Soares Tiago Silva | 1999 | POR Futebol Clube Do Porto | 04'17''17 | 626 |
| 7 | Fernandes Jose Pedro | 1999 | POR Sporting Clube De Braga | 04'19''52 | 609 |
| 8 | Nunes Diogo Barbosa | 2000 | POR Clube Fluvial Portuense | 04'19''91 | 607 |
| 9 | Sanles Manuel Tomes | 1999 | ESP Centro Gallego Tecnificacion Deportiva | 04'22''77 | 587 |
| 10 | Frota Paulo Andre | 2002 | POR Centro Apoio Soc Pais Amigos Da Escola | 04'23''11 | 585 |
| 11 | Travanca Sergio Filipe | 2000 | POR Clube Fluvial Portuense | 04'23''22 | 584 |
| 12 | Martins Pedro Veiguinha | 1996 | POR Sporting Clube De Braga | 04'24''31 | 577 |
| 13 | Amorim Ivan Emanuel | 2002 | POR Clube Fluvial Portuense | 04'24''46 | 576 |
| 14 | Silva Paulo Filipe | 1998 | POR Clube De Natacao Da Maia | 04'25''27 | 570 |
| 15 | Bastos Diogo Moreno | 2000 | POR Clube Fluvial Portuense | 04'25''53 | 569 |
| 16 | Riva Elia | 2001 | SUI Federazione Ticinese Nuoto | 04'26''51 | 563 |
| 17 | Travassos Rodrigo Alexandre | 2002 | POR Centro Apoio Soc Pais Amigos Da Escola | 04'26''93 | 560 |
| 18 | Afonso Ricardo Eduardo | 1997 | POR Sporting Clube De Braga | 04'28''50 | 550 |
| 19 | Pereira Joao Peixoto | 2001 | POR Sporting Clube De Braga | 04'30''28 | 539 |
| 20 | Sousa Diogo Nunes | 2003 | POR Vitoria Sport Clube/Olicargo | 04'30''51 | 538 |
| 21 | Carvalho Daniel Luis | 2002 | POR Sporting Clube De Braga | 04'30''55 | 538 |
| 22 | Hendrickx Dieter | 2001 | SUI Federazione Ticinese Nuoto | 04'30''70 | 537 |
| 23 | Freire Tiago Mendonca | 2001 | POR Leixoes Sport Club | 04'30''86 | 536 |
| 24 | Tocchetti Ajnur Elvezio | 2002 | SUI Federazione Ticinese Nuoto | 04'30''88 | 536 |
| 25 | Lima David Dias | 2000 | POR Clube Fluvial Vilacondense | 04'32''66 | 525 |
| 26 | Lobo Guilherme Diogo | 2002 | POR Futebol Clube Do Porto | 04'36''90 | 502 |
| 27 | Rodrigues Tiago Moura | 2003 | POR Colegio Luso-Internacional Do Porto | 04'37''52 | 498 |
| 28 | Dos Santos Andre Cardoso | 2003 | POR Academico Viseu Futebol Clube | 04'39''01 | 490 |
| 29 | Morim Pedro Soares | 2002 | POR Clube Naval Povoense | 04'39''37 | 488 |
| 30 | Santos Antonio Miguel | 2003 | POR Clube Fluvial Vilacondense | 04'39''76 | 486 |
| 31 | Salgado Goncalo Sampaio | 2002 | POR Grupo Desportivo De Natacao De Vila Nova De Famalicao | 04'40''49 | 482 |
| 32 | Silva Bernardo Costa | 2002 | POR Sporting Clube De Braga | 04'41''79 | 476 |
| 33 | Ferreira Goncalo Seixas | 2003 | POR Academico Viseu Futebol Clube | 04'49''00 | 441 |
| 34 | Silva Ruben Filipe | 2003 | POR Foca-Clube Natacao De Felgueiras | 04'49''01 | 441 |
| 35 | Martins Samuel Dias | 2002 | POR Colegio Liceal De Santa Maria De Lamas | 04'51''96 | 428 |
| 36 | Costa Joao Peres | 2004 | POR Clube Naval Praia Da Vitoria | 04'59''58 | 396 |
